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标题: 怎么在力场中加入Cd离子信息 [打印本页]

作者
Author: Taylor 时间: 2019-9-16 17:13
标题: 怎么在力场中加入Cd离子信息
请问各位大神，GROMACS力场没有Cd离子的信息，请问怎么加进去。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-9-16 22:58
google搜参数，恰当加入拓扑文件或者力场文件里

作者
Author: Taylor 时间: 2019-9-17 16:31

sobereva 发表于 2019-9-16 22:58
google搜参数，恰当加入拓扑文件或者力场文件里

老师，top文件中是通过pdb文件预处理之后才生成的，生成拓扑文件的时候，软件会提示没有该离子的信息，没办法在运行pdb2gmx这个命令之前把离子信息加进去

作者
Author: sobereva 时间: 2019-9-18 18:41

Taylor 发表于 2019-9-17 16:31
老师，top文件中是通过pdb文件预处理之后才生成的，生成拓扑文件的时候，软件会提示没有该离子的信息，没 ...

在rtp文件里自行加入离子的字段（可以参考rtp里已有的离子的字段）

作者
Author: Taylor 时间: 2019-9-21 21:33

sobereva 发表于 2019-9-18 18:41
在rtp文件里自行加入离子的字段（可以参考rtp里已有的离子的字段）

好的老师，我试试。

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