计算化学公社

标题: 请教：真空层设多厚？ [打印本页]

作者
Author: yihanxu 时间: 2019-9-19 13:13
标题: 请教：真空层设多厚？
本帖最后由 yihanxu 于 2019-9-18 23:22 编辑

Sob老师好，想请教您15年模拟真空-氯化钠溶液界面体系的文章为什么要在体系两侧各留4nm的真空层呢？记得在模拟溶剂中的蛋白质体系的时候为避免蛋白质与镜像作用留1nm的蛋白质-盒子边界距离即可，这和真空层的情况是有什么不同的考虑呢？感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-9-19 15:29
4nm非常安全，再小点也行，但小太多的话可能有审稿人质疑，可能还要求你检验随真空层厚度的收敛性之类。而且真空区没有粒子，虽然加大也会令耗时增加，但不会像模拟蛋白质在水溶液那样一增加盒子边界厚度就导致粒子数迅速增加而严重增加耗时。

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