计算化学公社

标题: 请问怎么用VMD在水盒子中挖出一个球形区域（已知球心坐标和半径）？谢谢 [打印本页]

作者
Author: @Bruce 时间: 2019-9-20 13:00
标题: 请问怎么用VMD在水盒子中挖出一个球形区域（已知球心坐标和半径）？谢谢
请问怎么用VMD在一个水盒子中挖出一个球形区域（已知球心坐标和半径）？谢谢

作者
Author: 16aDream 时间: 2019-9-20 16:42
找到位于球心的一个水分子，保留距离这个水分子一定距离以外的水分子就行

作者
Author: sobereva 时间: 2019-9-20 23:18
保存结构的时候输入恰当的选择语句，参考
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

作者
Author: @Bruce 时间: 2019-9-21 14:03

sobereva 发表于 2019-9-20 23:18
保存结构的时候输入恰当的选择语句，参考
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http ...

谢谢老师。
还有个问题请教老师您，比如有一个水分子只有氧原子在球形区域内，怎么把整个水分子也一起选中？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-9-23 07:55

@Bruce 发表于 2019-9-21 14:03
谢谢老师。
还有个问题请教老师您，比如有一个水分子只有氧原子在球形区域内，怎么把整个水分子也一起选 ...

same resid as [选择语句]

作者
Author: @Bruce 时间: 2019-9-23 10:18

sobereva 发表于 2019-9-23 07:55
same resid as [选择语句]

好的，谢谢老师您

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