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标题: NAMD与Gaussian的interface问题 [打印本页]

作者
Author:
liyunpeng    时间: 2019-9-24 19:18
标题: NAMD与Gaussian的interface问题
NAMD的官网里面有Hybrid QM/MM 的Gaussian接口,是NAMD里面的一个脚本文件run_gaussian.py,但是我在用QwikMD准备的结构跑QM/MM MD时脚本卡在这个地方跑不下去了,也没有出现报错中断,这是什么问题呢?向各位老师请教。
卡住的地方,脚本在这之后用top查看一直都在运行,但没有生成预期的“*.input.result”文件。
TCL: Minimizing for 100 steps
Info: List of ranks running QM simulations: 0.
Sum of the charges:  -1.000001999999999
Gaussian self energy of the charges:  -15.7968446688
SCF energy:  -106152.811562
修改Gaussian执行路径和关键字的文件:


作者
Author:
fhh2626    时间: 2019-9-25 11:18
不建议用这个脚本,建议用内置的QM/MM界面用NAMD连接Orca(况且用高斯多慢啊)




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