标题: NAMD与Gaussian的interface问题 [打印本页] 作者Author: liyunpeng 时间: 2019-9-24 19:18 标题: NAMD与Gaussian的interface问题 NAMD的官网里面有Hybrid QM/MM 的Gaussian接口,是NAMD里面的一个脚本文件run_gaussian.py,但是我在用QwikMD准备的结构跑QM/MM MD时脚本卡在这个地方跑不下去了,也没有出现报错中断,这是什么问题呢?向各位老师请教。
卡住的地方,脚本在这之后用top查看一直都在运行,但没有生成预期的“*.input.result”文件。
TCL: Minimizing for 100 steps
Info: List of ranks running QM simulations: 0.
Sum of the charges: -1.000001999999999
Gaussian self energy of the charges: -15.7968446688
SCF energy: -106152.811562
修改Gaussian执行路径和关键字的文件: