计算化学公社

标题: 用于分子模拟和简单量化模拟服务器配置咨询 [打印本页]

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mangix    时间: 2019-9-30 15:47
标题: 用于分子模拟和简单量化模拟服务器配置咨询
各位老师,请教一下,本人主要用分子模拟方法研究多孔材料的吸附分离性能,即主要用来跑MC和MD任务,还会进行一些简单的量化计算,比如计算电荷、结合能等。预算在2W左右,是否可以用Sobereva老师推荐的“较好双路服务器推荐配置”,即:


CPU:2* XEON E5-2696 v3(18核2.3G,散,无集显)2*3900
散热器:酷冷至尊T400i*2  80*2
主板:超微 X10DRL-I(C612芯片组,集显) 1700
硬盘:希捷ST4000NM0033企业级4TB SATA 600
内存:三星DDR4-2400 ECC 8*16GB   8*550
电源:海韵S12II-620(额定620W)或 台达NX650(额定650W) 皆530
机箱:先马泰坦豪华黑 290


请问,如果不是很合适的话,哪里需要进行改动呢?
谢谢。

作者
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qinzhong605    时间: 2019-9-30 18:03
加1张rtx2060以上级别的显卡,电源换成台达800W以上的,钱够多的话,散热器换成猫牌的,其他的照抄社长的即可。
作者
Author:
sobereva    时间: 2019-10-1 02:40
着看你用什么程序做分子模拟
如果支持GPU加速,建议上RTX 2080或RTX2080 SUPER,性能能提升很多。届时建议上个1000W电源。关于GPU加速该用什么卡、该用什么电源,文中已经说了
作者
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mangix    时间: 2019-10-6 09:29
qinzhong605 发表于 2019-9-30 18:03
加1张rtx2060以上级别的显卡,电源换成台达800W以上的,钱够多的话,散热器换成猫牌的,其他的照抄社长的即 ...

谢谢,明白了
作者
Author:
mangix    时间: 2019-10-6 09:30
sobereva 发表于 2019-10-1 02:40
着看你用什么程序做分子模拟
如果支持GPU加速,建议上RTX 2080或RTX2080 SUPER,性能能提升很多。届时建议 ...

打算用北化的一个老师编写的CADSS来进行计算。
谢谢sob老师指导
作者
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ezez    时间: 2019-10-6 11:18
sobereva 发表于 2019-10-1 02:40
着看你用什么程序做分子模拟
如果支持GPU加速,建议上RTX 2080或RTX2080 SUPER,性能能提升很多。届时建议 ...

"RTX 2080或RTX2080 SUPER"和1080ti,从性价比来说,哪个好?
主要用于GPU跑MD
作者
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lichengjian    时间: 2019-11-28 23:27
mangix 发表于 2019-10-6 09:30
打算用北化的一个老师编写的CADSS来进行计算。
谢谢sob老师指导

北化的哪位老师?
作者
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sobereva    时间: 2019-11-29 10:01
ezez 发表于 2019-10-6 11:18
"RTX 2080或RTX2080 SUPER"和1080ti,从性价比来说,哪个好?
主要用于GPU跑MD

1080Ti现在都没新货了
买2080
作者
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ezez    时间: 2019-11-29 13:08
sobereva 发表于 2019-11-29 10:01
1080Ti现在都没新货了
买2080

谢谢社长

那1080Ti和2080在GPU加速跑MD方面的差别如何?
作者
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sobereva    时间: 2019-11-30 03:17
ezez 发表于 2019-11-29 13:08
谢谢社长

那1080Ti和2080在GPU加速跑MD方面的差别如何?

这里有gromacs下的对比
https://openbenchmarking.org/result/1901228-SK-1812259PT23

作者
Author:
ezez    时间: 2019-11-30 11:19
sobereva 发表于 2019-11-30 03:17
这里有gromacs下的对比
https://openbenchmarking.org/result/1901228-SK-1812259PT23

看来2080似乎更优一筹,谢谢社长~
作者
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lao7    时间: 2019-11-30 22:48
ezez 发表于 2019-10-6 11:18
"RTX 2080或RTX2080 SUPER"和1080ti,从性价比来说,哪个好?
主要用于GPU跑MD

贵的好
作者
Author:
ezez    时间: 2019-12-1 11:31
lao7 发表于 2019-11-30 22:48
贵的好

恩,有道理~~~




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