计算化学公社

标题: GROMACS运行报错Illegal instruction [打印本页]

作者
Author:
snow_wl    时间: 2019-10-6 14:11
标题: GROMACS运行报错Illegal instruction
老师你好,本人初学GROMACS,我们服务器已经安装gromacs(2018.4.knl),为什么我运行gmx_sp 等命令 (如gmx_sp solvate -box 3 3 3 -o h2o.gro)一直报错Illegal instruction呢?

作者
Author:
bobosiji    时间: 2019-10-6 15:24
没安装好。或者这个gmx编译的CPU和你现在运行gmx的CPU很不一样(比如 开了avx512加速的gold vs E5)
作者
Author:
sobereva    时间: 2019-10-7 07:00
gmx_sp、2018.4.knl是什么鬼
严格按照此文在你的服务器上编译gromacs,什么问题也不会有。别把别的机子编译的直接拷来用

GROMACS的安装方法(含全程视频演示)
http://sobereva.com/457http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html
作者
Author:
snow_wl    时间: 2019-10-7 10:06
bobosiji 发表于 2019-10-6 15:24
没安装好。或者这个gmx编译的CPU和你现在运行gmx的CPU很不一样(比如 开了avx512加速的gold vs E5)

谢谢了,我自己重新安装了一个,这回能用了
作者
Author:
snow_wl    时间: 2019-10-7 10:07
sobereva 发表于 2019-10-7 07:00
gmx_sp、2018.4.knl是什么鬼
严格按照此文在你的服务器上编译gromacs,什么问题也不会有。别把别的机子编 ...

听从老师指挥,自己安装了一个这回可以了




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3