计算化学公社

标题: 计算AIMD跑出来的某一帧结构的单点能的问题 [打印本页]

作者
Author:
captain    时间: 2019-10-9 11:00
标题: 计算AIMD跑出来的某一帧结构的单点能的问题
请问大神
想在高精度基组下计算这个结构的能量,
还有必要以这个结构为基础重新进行结构优化(opt)吗?
谢谢指导!



作者
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sobereva    时间: 2019-10-9 22:41
看具体目的,若无特殊必要不需要优化。如果你的目的是靠AIMD进行势能面采样,之后算极小点结构的目的则需要优化
作者
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captain    时间: 2019-10-9 22:57
sobereva 发表于 2019-10-9 22:41
看具体目的,若无特殊必要不需要优化。如果你的目的是靠AIMD进行势能面采样,之后算极小点结构的目的则需要 ...

明白了 谢大神!
作者
Author:
captain    时间: 2020-2-21 20:20
sobereva 发表于 2019-10-9 22:41
看具体目的,若无特殊必要不需要优化。如果你的目的是靠AIMD进行势能面采样,之后算极小点结构的目的则需要 ...

还想请问大神,
AIMD跑出来的某一帧结构还需要做频率分析以证明是能量极小点结构吗?
如果需要的话,是直接以当前结构做频率分析,还是在当前结构的基础上重新优化再对优化结构做频率分析?
十分感谢!
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-2-22 17:52
captain 发表于 2020-2-21 20:20
还想请问大神,
AIMD跑出来的某一帧结构还需要做频率分析以证明是能量极小点结构吗?
如果需要的话,是 ...

MD过程中由于有热运动,不可能某一帧恰好落到极小点。如果你想证明某一帧结构是在某个极小点附近,并且想得到这个极小点的确切位置,就需要优化并做振动分析。
对MD过程产生的结构直接做振动分析没有任何意义。
作者
Author:
captain    时间: 2020-2-22 18:10
sobereva 发表于 2020-2-22 17:52
MD过程中由于有热运动,不可能某一帧恰好落到极小点。如果你想证明某一帧结构是在某个极小点附近,并且想 ...

明白了,谢大神指导!




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