计算化学公社

标题: 求助Material studio粗粒化模拟建环状模型方法 [打印本页]

作者
Author:
weirdo    时间: 2019-10-9 12:39
标题: 求助Material studio粗粒化模拟建环状模型方法
如题,想请教各位用MS如何做出一个闭环的粗粒化模型??
我需要把三个或四个柱子连成一个环而不是线性连接
请问需要怎么操作?????

作者
Author:
xjp1127721434    时间: 2019-10-18 20:01
先用碳原子建个环,然后对每个原子粗粒化。得到你想要的环形粗粒化模型,然后把模型上的珠子换了就行。
作者
Author:
星空DMU    时间: 2019-11-1 09:16
xjp1127721434 发表于 2019-10-18 20:01
先用碳原子建个环,然后对每个原子粗粒化。得到你想要的环形粗粒化模型,然后把模型上的珠子换了就行。

请问怎么把每个原子粗粒化,怎么换珠子,
作者
Author:
huangjin    时间: 2020-4-2 12:42
你先把你要粗粒化的分子画出来,然后用Coarse Grain中的motion groups自己设定需要划为一个粗粒化珠子的原子,然后生成粗粒化分子
作者
Author:
lisa25496    时间: 2020-4-9 17:41
huangjin 发表于 2020-4-2 12:42
你先把你要粗粒化的分子画出来,然后用Coarse Grain中的motion groups自己设定需要划为一个粗粒化珠子的原 ...

你好 请问如果要对网状结构进行粗粒化时有部分原子会共用 这该怎么办  
作者
Author:
张浩东    时间: 2020-7-21 08:09
谢谢

作者
Author:
huangjin    时间: 2020-8-16 08:37
lisa25496 发表于 2020-4-9 17:41
你好 请问如果要对网状结构进行粗粒化时有部分原子会共用 这该怎么办

把共用的原子划分到其中一个粗粒化珠子中,另一个粗粒化珠子就不使用这个共用原子
作者
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lisa25496    时间: 2020-9-22 09:41
huangjin 发表于 2020-8-16 08:37
把共用的原子划分到其中一个粗粒化珠子中,另一个粗粒化珠子就不使用这个共用原子

好的 谢谢




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