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标题: ONIOM分层计算中背景电荷怎么设置? [打印本页]

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豌豆芽    时间: 2019-10-18 10:38
标题: ONIOM分层计算中背景电荷怎么设置?
各位老师,我想用ONIOM分层计算,LOW层设置成背景电荷,然后进行计算。
我的问题:1.这种方法可行吗?
                  2.输入文件怎么具体怎么设置?
ps:使用高斯;原子个数不多,十几个。

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让你变成回忆    时间: 2019-10-18 10:44
本帖最后由 让你变成回忆 于 2019-10-18 10:51 编辑

可行,
关键词部分加上charge关键词,坐标部分结束以后,空一行写:
x  y  z  charges (背景电荷的x、y、z坐标以及带电量)
...
直到所有的背景电荷指定完成。
作者
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豌豆芽    时间: 2019-10-18 11:03
让你变成回忆 发表于 2019-10-18 10:44
可行,
关键词部分加上charge关键词,坐标部分结束以后,空一行写:
x  y  z  charges (背景电荷的x、y ...

非常感谢,麻烦再问一下,charges的值根据什么确定?

作者
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小范范1989    时间: 2019-10-18 11:24
http://sobereva.com/332
作者
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豌豆芽    时间: 2019-10-18 13:13
小范范1989 发表于 2019-10-18 11:24
http://sobereva.com/332

麻烦问一下,一定要用您发的链接里的程序吗?因为我的原子不多,有没有其他的方法获得charge值呢?
作者
Author:
小范范1989    时间: 2019-10-18 13:26
豌豆芽 发表于 2019-10-18 13:13
麻烦问一下,一定要用您发的链接里的程序吗?因为我的原子不多,有没有其他的方法获得charge值呢?

那就单算就是了、思路和帖子中一样。
作者
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让你变成回忆    时间: 2019-10-18 13:49
豌豆芽 发表于 2019-10-18 11:03
非常感谢,麻烦再问一下,charges的值根据什么确定?

这个涉及到原子电荷的具体计算方式,sob老师有过一篇论文,大概名字叫《原子电荷的计算方法》(具体我记不太清了),你可以在论坛里找找,看看用什么方式计算你的体系的原子电荷。
我一般会用RESP电荷,这个用Multiwfn也很容易计算,也有相关的帖子,你仔细找找。
作者
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sobereva    时间: 2019-10-19 08:20
豌豆芽 发表于 2019-10-18 13:13
麻烦问一下,一定要用您发的链接里的程序吗?因为我的原子不多,有没有其他的方法获得charge值呢?

适合用拟合静电势电荷。CHELPG就可以,RESP亦可,相关知识看

RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html
原子电荷计算方法的对比(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml
作者
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豌豆芽    时间: 2019-10-19 09:47
让你变成回忆 发表于 2019-10-18 13:49
这个涉及到原子电荷的具体计算方式,sob老师有过一篇论文,大概名字叫《原子电荷的计算方法》(具体我记 ...

非常感谢您,对我帮助很大
作者
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豌豆芽    时间: 2019-10-19 09:48
sobereva 发表于 2019-10-19 08:20
适合用拟合静电势电荷。CHELPG就可以,RESP亦可,相关知识看

RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn ...

谢谢老师
作者
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石头    时间: 2020-11-12 17:21
让你变成回忆 发表于 2019-10-18 13:49
这个涉及到原子电荷的具体计算方式,sob老师有过一篇论文,大概名字叫《原子电荷的计算方法》(具体我记 ...

您好!请问用multiwfn进行这个RESP电荷的计算,是用ONIOM优化完的chk文件转化为fchk文件做的吗?我想做L层RESP电荷的计算,但是整体用oniom优化完转化为fchk后,Multiwfn打不开。还是需要怎么处理一下呢?
作者
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sobereva    时间: 2020-11-15 08:38
石头 发表于 2020-11-12 17:21
您好!请问用multiwfn进行这个RESP电荷的计算,是用ONIOM优化完的chk文件转化为fchk文件做的吗?我想做L ...

http://bbs.keinsci.com/thread-15419-1-1.html
作者
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石头    时间: 2020-11-16 08:18
sobereva 发表于 2020-11-15 08:38
http://bbs.keinsci.com/thread-15419-1-1.html

明白了,感谢Sob老师!




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