计算化学公社

标题: 求助核磁计算是否对坐标修改设置 [打印本页]

作者
Author: wzy 时间: 2019-10-23 20:36
标题: 求助核磁计算是否对坐标修改设置
老师，计算芳香族的还有对坐标进行鬼原子设置，那么计算其他分子核磁是否需要同类设置，还是使用原分子坐标直接加NMR关键词就可以？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-24 00:00
你不去算NICS、ICSS就完全不牵扯鬼原子，对于芳香类化合物和普通化合物都一样

作者
Author: wzy 时间: 2019-10-24 15:10
本帖最后由 wzy 于 2019-10-24 20:38 编辑

sobereva 发表于 2019-10-24 00:00
你不去算NICS、ICSS就完全不牵扯鬼原子，对于芳香类化合物和普通化合物都一样

1.谢谢老师，算出来四甲基硅烷的iso，但是σisoH的数值都不一样，是取平均数？还是怎么选？2.
%nproc=32
%chk=1.chk
%mem=1GB
#p B3LYP/6-31G(d,p) opt freq EmpiricalDispersion=GD3BJ scrf(CPCM,solvent=water) pop=NBO NMR

T

0 1
C                3.36193113 1.94101185 1.93679980
H                2.56129937 4.43630064 2.81221298
N                3.15938526 3.24015089 1.22796590
O                2.89577746 1.67187790 3.01508285
N                4.38574561 1.11603245 1.22796590
C                3.94942106 3.30154135 0.00000000
C                4.75806957 -0.00000000 1.75321903
这样写可以不，老师，同时计算水相下的核磁和NBO？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-26 04:28

wzy 发表于 2019-10-24 15:10
1.谢谢老师，算出来四甲基硅烷的iso，但是σisoH的数值都不一样，是取平均数？还是怎么选？2 ...

先确保初始结构满足Td点群再说，否则肯定有可查觉的数值误差导致轻微破坏等价性

强烈不建议用CPCM，这里说了
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327（http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html）

NMR和NBO可以

作者
Author: wzy 时间: 2019-10-26 12:35
嗯，谢谢老师，知道了，请教老师怎么画好看的核磁图

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-27 01:15

wzy 发表于 2019-10-26 12:35
嗯，谢谢老师，知道了，请教老师怎么画好看的核磁图

gview画出来，然后导出曲线数据，导入到origin之类程序里，恰当设置就好看了

作者
Author: wzy 时间: 2019-10-28 20:07
本帖最后由 wzy 于 2019-10-28 20:35 编辑

sobereva 发表于 2019-10-27 01:15
gview画出来，然后导出曲线数据，导入到origin之类程序里，恰当设置就好看了

老师，使用NMR计算出gview导出origin中和TMS求差后要归一化0-10作为横坐标？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-29 07:38

wzy 发表于 2019-10-28 20:07
老师，使用NMR计算出gview导出origin中和TMS求差后要归一化0-10作为横坐标？

病句，看不懂
弄成和gview显示的一样的就完了

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)