计算化学公社

标题: 安装并行版LAMMPS的Makefile的填写问题全记录（可参考） [打印本页]

作者
Author: 少年爱吃地三鲜 时间: 2019-10-29 20:51
标题: 安装并行版LAMMPS的Makefile的填写问题全记录（可参考）
本帖最后由少年爱吃地三鲜于 2019-10-29 21:40 编辑

尊敬的老师们，关于lammps并行版本的安装，网上众说纷纭，没用一个统一的方法，我这里有一个安装并行版本的word可供大家参考我把fftw3和mpich3都安装在了/root/lammps/下。
但是编写Makefile的时候是这样的
MPI_INC =    -DMPICH_SKIP_MPICXX #-I/root/lammps/mpich3/include
MPI_PATH = #-L/root/lammps/mpich3/lib
MPI_LIB = #-lmpixh -lmpl -lpthread

# FFT library
# see discussion in Section 2.2 (step 6) of manual
# can be left blank to use provided KISS FFT library
# INC = -DFFT setting, e.g. -DFFT_FFTW, FFT compiler settings
# PATH = path for FFT library
# LIB = name of FFT library

FFT_INC =  -DFFT_FFTW3 -I/root/lammps/fftw3/include
FFT_PATH = -L/root/lammps/fftw3/lib
FFT_LIB =-lfftw3

fftw和mpich环境变量是这么写的：

export PATH=/root/lammps/mpich3/bin:$PATH
export PATH=/root/lammps/fftw3/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/root/lammps/fftw3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/root/lammps/mpich3/lib:$LD_LIBRARY_PATH

作者
Author: 少年爱吃地三鲜 时间: 2019-10-29 20:53
本帖最后由少年爱吃地三鲜于 2019-10-29 21:40 编辑

word中的这个部分[size=18.6667px]唯一需要改的就是fftw和mpich的路径

四．安装lammps

4.1 解压 tar –xvf lammps-stable.tar.gz

4.2 进入lammps/src/MAKE

4.3 修改Makefile.mpi

修改两部分（标红的地方修改）

MPI_INC = -DMPICH_SKIP_MPICH2 -I/usr/local/mpich2/include # 即mpi.h的路径

MPI_PATH = -L/usr/local/mpich2/lib # 即libmpich.a的路径

MPI_LIB = -lmpich –lmp –lpthread

FFT_INC = -DFFT_FFTW2 -I/usr/local/fftw2/include #即fftw.h的路径

FFT_PATH = -L/usr/local/fftw2/lib

FFT_LIB=-lfftw3

4.5 进入lammps/src目录

4.6 make clean-all

4.7 make mpi

作者
Author: 413 时间: 2019-10-29 21:05
你需要给出报的（具体的）Error信息

作者
Author: 少年爱吃地三鲜 时间: 2019-10-29 21:30

413 发表于 2019-10-29 21:05
你需要给出报的（具体的）Error信息

已经解决了！感谢

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