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标题: 酶催化底物TS过渡态，理论位点不断键？ [打印本页]

作者
Author: lao7 时间: 2019-10-31 08:50
标题: 酶催化底物TS过渡态，理论位点不断键？
大家好！我用TS计算了一下酶催化底物的过渡态，但是发现底物分子根本就没有键的断裂，甚至连理论断键部位的键长都无明显变化（运行了52步，但整体结构变化和结构优化差不多）。该分子体系、计算是严格按照之前文献做的。请问，有无指定区域断键的计算？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-31 16:14
如果你是指Gaussian做的opt=TS，没有所谓的“定区域断键的计算”
较大可能是过渡态初猜不合理，较小概率是计算级别或者模型的问题。
恰当时候可以考虑柔性扫描帮助确定过渡态初猜

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