计算化学公社

标题: 在做一个六元环的优化，可是优化完变成五元环？ [打印本页]

作者
Author: superXiuTai 时间: 2019-10-31 09:59
标题: 在做一个六元环的优化，可是优化完变成五元环？

如题所示，问一下各位大佬怎么解决这个问题啊

这是优化的条件

CalculationType = FREQ

CalculationMethod = RB3LYP

BasisSet = 6-31G(d)

Charge= 0

Spin= Singlet

作者
Author: superXiuTai 时间: 2019-10-31 09:59
不好意思，图片放反了

作者
Author: sobereva 时间: 2019-10-31 16:16

superXiuTai 发表于 2019-10-31 09:59
不好意思，图片放反了

发现原帖有问题时直接编辑原帖，不要在回帖里说明。帖子标题不要联用三个问号，给你改了。

原先那个结构成键方式比较罕见，可能本来就不能稳定存在
如果有什么证据可以证明那个结构就是存在的，尝试其它计算级别，比如用M062X/6-311G* opt进行优化

作者
Author: superXiuTai 时间: 2019-10-31 17:20
先谢谢老师了，然后这个分子是已经发表在advanced materials的一篇文章中DOI: 10.1002/adma.201702354，然后他们也是做了 B3LYP/6-31G(d) density functional theory的opt，所以不知道为什么我画了一样的跑了两次的结果都是变成了五元环，我先试试您的方法优化一下

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-1 07:34

superXiuTai 发表于 2019-10-31 17:20
先谢谢老师了，然后这个分子是已经发表在advanced materials的一篇文章中DOI: 10.1002/adma.201702354，然 ...

如果文章补充材料里直接给了结构，直接拿过来当初始结构用。没给的话可以找作者要，只要告诉对方给了你结构，以后发文章引他们的，一般会给。

作者
Author: superXiuTai 时间: 2019-11-1 12:06
好的，谢谢老师了

作者
Author: baisl 时间: 2019-11-1 18:30

superXiuTai 发表于 2019-11-1 12:06
好的，谢谢老师了

你的那个结构不可能存在，你在好好看看文献是不是漏掉了氢原子。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)