计算化学公社

标题: 如何实现分子沿两个不同方向的角度同时旋转? [打印本页]

作者
Author:
mozixingchen    时间: 2019-11-1 19:15
标题: 如何实现分子沿两个不同方向的角度同时旋转?
本帖最后由 mozixingchen 于 2019-11-1 19:15 编辑

如题,最近看到这篇文献,这里面的旋转看起来很复杂,可以实现两个角度同时旋转并计算得到数据,此外还可以沿着不同的方向如[010]、 [111]等去旋转。
Q1:文献中计算方法部分只提到了vasp,那么这些计算是只用vasp就能实现的吗?

Q2:如图14a和15这种沿着θ和φ两个不同方向上同时旋转要怎样才能实现?如何得到这种二维的数据?

Q3:如图12的结果,如何让客体MA分子沿着想要的轴去旋转和平移,譬如:[100]、[010]、[111]等,怎么做?


Q4:如图14b中,这么完整的势能面是如何得到的?Polar plot of orientational energy surface这个是什么意思?


以上每个问题对我这个新手来说都是非常难的点,请各位老师不吝赐教,知无不言言无不尽,不胜感激!


作者
Author:
hxd_yi    时间: 2019-11-1 21:15
我猜文章中用到了四元数进行旋转操作(因为旋转角它用2alpha表示),建议您看一下如何通过使用四元数的运算完成旋转。
作者
Author:
granvia    时间: 2019-11-1 21:29
hxd_yi 发表于 2019-11-1 21:15
我猜文章中用到了四元数进行旋转操作(因为旋转角它用2alpha表示),建议您看一下如何通过使用四元数的运算 ...

把极坐标说得这么高大上:D
作者
Author:
mozixingchen    时间: 2019-11-4 09:21
本帖最后由 mozixingchen 于 2019-11-4 09:22 编辑
granvia 发表于 2019-11-1 21:29
把极坐标说得这么高大上:D

谢谢老师回复!请问您能具体说一下吗?顺便能否请您也回答一下我其它的问题吗?多谢多谢!
作者
Author:
mozixingchen    时间: 2019-11-4 09:21
hxd_yi 发表于 2019-11-1 21:15
我猜文章中用到了四元数进行旋转操作(因为旋转角它用2alpha表示),建议您看一下如何通过使用四元数的运算 ...

谢谢您的回复!




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3