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标题: 求助！如何在amber中使用AMOEBA力场? [打印本页]

作者
Author: 好好学习打怪兽 时间: 2015-7-27 20:33
标题: 求助！如何在amber中使用AMOEBA力场?
求助，各位大侠，需要研究在amber中使用AMOEBA力场来模拟显性溶剂下的蛋白，但是我在amber中sleap，source leaprc.amoeba，后无法载入蛋白。在网上也搜索不到amber中AMOEBA力场的具体用法，或者sleap的用法。跪求各位大侠指点，如何在amber中使用AMOEBA力场！

作者
Author: sobereva 时间: 2015-7-27 22:04
leaprc.amoeba我没亲自用过，或许leaprc.amoeba本身就没有带蛋白相关的东西，建议直接打开此文件看看，有没有载入氨基酸的库之类的。

作者
Author: 好好学习打怪兽 时间: 2015-7-28 09:07

sobereva 发表于 2015-7-27 22:04
leaprc.amoeba我没亲自用过，或许leaprc.amoeba本身就没有带蛋白相关的东西，建议直接打开此文件看看，有没 ...

报告老师这个我看了现在能载入蛋白了但是水盒子加不上

作者
Author: 好好学习打怪兽 时间: 2015-7-28 10:41
已解决。感谢帮助

作者
Author: hanlan8702 时间: 2024-2-28 14:27
请教一下如何安装amber才能获取leaprc.amoeba这个文件，谢谢。

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