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标题: 两个芳香环之间的二面角柔性扫描求助 [打印本页]

作者
Author: enthalpy 时间: 2019-11-1 20:47
标题: 两个芳香环之间的二面角柔性扫描求助
大家好！我用gaussian 对分子的二面角进行柔性扫描，有两个问题要向大家请教。谢谢各位！

1 由于存在对称性，做二面角扫描是否就可以只对部份区间作扫描，比如在0-180 度之间来得到0-360 全部区间的势能变化，如果以此发表文章大家是否认可？

2 通常是否可以分段扫描不同区间（从计算速度考虑，多个任务同时进行），最后将其合并得到整个区间势能变化？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-2 08:35
1 柔性扫描有滞后问题，即不被扫描的变量初始坐标是上一步扫描的最终的坐标，所以把0-180对称地拼起来和直接扫0-360不一定相同

2 由于上述原因，这和做一次完整柔性扫描有时是不等价的

作者
Author: enthalpy 时间: 2019-11-2 09:56

sobereva 发表于 2019-11-2 08:35
1 柔性扫描有滞后问题，即不被扫描的变量初始坐标是上一步扫描的最终的坐标，所以把0-180对称地拼起来和直 ...

谢谢sob老师的解答！

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