计算化学公社

标题: AIM中在两个原子之间有键临界点，能否说明此处有相互作用 [打印本页]

作者
Author: 夜千 时间: 2019-11-4 17:02
标题: AIM中在两个原子之间有键临界点，能否说明此处有相互作用
本帖最后由夜千于 2019-11-4 17:08 编辑

各位老师好，
我在分析一个过渡态时，这是一个简单的质子转移反应，发现在非反应位点的H……F之间存在（3，-1），此处的H不参与质子转移反应，参与质子转移反应的H为图中54.57旁边的H，是从CH2转移到N上。具体数值如图一,v(r)值仅为-0.006.AIM图为图二，要分析的HF是71.随后,我将此处CF3基团更改为CH3以及C-(CH3)3，这一步的能垒升高3Kcal.能否通过这个说明此处的HF存在弱相互作用，使这一步反应更容易进行。

我做了RDG等值面图。在HF之间存在绿色区域，、能否结合这两个数据说明CF3与H之间有相互作用,有利于这个质子转移反应的进行。第四个附件是该反应的过渡态

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-5 08:10
首先要明白，弱相互作用无处不在，这点你如果知道分子力场的非键作用计算公式就会很清楚，这绝对不取决于是否有BCP。而且有BCP也不代表就有显著的弱相互作用，比如两个隔着几埃的He原子之间也照样能找到BCP，但显然弱相互程度几乎可以完全忽略。BCP是从数学层面定义的而非化学或物理层面定义的，只是有的时候能在研究化学问题上用得着而已，不要太教条。

暂且不说C-(CH3)3，毕竟基团尺寸和CF3相差太大，光说换成CH3之后能垒升高，这很难和弱相互作用联想到一起。重点应当放在CH3的电子效应上，即CF3倾向于吸电子，CH3则相对倾向于给电子，这影响旁边CH2上的电子结构，这个碳上电子越多，可能是质子越难转移走的原因。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)