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标题: 改变蛋白在盒子中的位置问题 [打印本页]

作者
Author: mjluan 时间: 2019-11-4 21:12
标题: 改变蛋白在盒子中的位置问题
老师，我构建了一个含有蛋白质的水盒子，现在想把蛋白质移到盒子的边缘，不想让它在正中间，可以怎么处理呢？
我试过用vmd将预平衡好的结构文件中的蛋白移动，但是md报错了Fatal error:
No molecules were defined in the system
或者可以在最初把蛋白塞进盒子以后就移动位置嘛？
谢谢老师

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-5 08:25
我不晓得你怎么移动的。gmx trjconv加上-trans [平移矢量] 可以整体平移

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