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标题: VMD做电子激发过程中空穴和电子的等值面分子被遮挡 [打印本页]

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Author: 艾笑 时间: 2019-11-13 16:54
标题: VMD做电子激发过程中空穴和电子的等值面分子被遮挡
Sobereva老师，我在给分子做electron和hole的等值面图形显示的时候，分子来回被线条遮挡，虽然等值面也显示，只有转动到一定的角度分子中的等值面的图才可以看见，线条面怎样去除呢？

有没小伙伴遇到我这样的问题的，怎么解决的呢？
我是按照http://sobereva.com/483做的

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Author: sobereva 时间: 2019-11-13 17:45
不要24小时内同时在公社QQ群和公社论坛里同一问题，注意看群文件里群规，以及论坛置顶的计算化学公社论坛新人必读。

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Author: 艾笑 时间: 2019-11-13 22:02

sobereva 发表于 2019-11-13 17:45
不要24小时内同时在公社QQ群和公社论坛里同一问题，注意看群文件里群规，以及论坛置顶的计算化学公社论坛新 ...

收到老师不好意思我没有注意到群规，老师我处理的时候发现hole的等值面显示是没有问题的，只有electron的时候会出现这种问题，我不清楚这是什么原因，查看 showcub.vmd中的两个 filename1.cub没有差别，就是找不到原因，为什么electron的显示有问题

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Author: sobereva 时间: 2019-11-13 22:26

艾笑发表于 2019-11-13 22:02
收到老师不好意思我没有注意到群规，老师我处理的时候发现hole的等值面显示是没有问题的，只有electr ...

你先在Multiwfn里直接看等值面，如果看到的正常，就是VMD的问题。

如果在Multiwfn里直接看到的等值面也是类似异常的，把给Multiwfn用的Gaussian输出文件、fch文件都压缩后上传（如果超过5MB，用网盘），我看看到底是程序产生的格点数据问题还是什么其它情况，并且把你在Multiwfn里输入的命令都告诉我。

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Author: 艾笑 时间: 2019-11-14 14:21

sobereva 发表于 2019-11-13 22:26
你先在Multiwfn里直接看等值面，如果看到的正常，就是VMD的问题。

如果在Multiwfn里直接看到的等值面 ...

谢谢老师的帮助，已经把这个问题处理好了，在用Multiwfn选择2 Local term only形成cube文件，分子就没有外边的边框啦！开熏~~~

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Author: sobereva 时间: 2019-11-15 00:29

艾笑发表于 2019-11-14 14:21
谢谢老师的帮助，已经把这个问题处理好了，在用Multiwfn选择2 Local term only形成cube文件，分子就没有 ...

注意这样得到的是不严格的

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