计算化学公社

标题: Gaussian 09需要设置哪些参数，精度才能与16一致？ [打印本页]

作者
Author: wrtgcn 时间: 2019-11-18 11:15
标题: Gaussian 09需要设置哪些参数，精度才能与16一致？
身边有一台可以跑Gaussian 09的主机，想在上面做点计算。但是之前的很多结果都是使用Gaussian 16跑的，想请教一下大家，在09的输入文件设置哪些参数，才能与16版的默认精度一致？我记得之前看社长提过，16默认用的int=ultrafine，除此之外还有需要注意的地方吗？谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-18 11:23
int(acc2e=12,ultrafine)
对于使用了溶剂模型的情况，g09没法和g16精确做到一致，只能让g16做到和g09一致（g09default关键词）

作者
Author: wrtgcn 时间: 2019-11-18 11:49

sobereva 发表于 2019-11-18 11:23
int(acc2e=12,ultrafine)
对于使用了溶剂模型的情况，g09没法和g16精确做到一致，只能让g16做到和g09一致 ...

谢谢社长。还想多请教您一个问题，60个非金属原子的体系，一般用多少个核计算比较合适？我现在这边学校管服务器的人不太了解高斯，直接让我一次用一个节点24核计算，说是这样速度快。我觉得他好像是懒得给我设置了。。

作者
Author: alystone 时间: 2019-11-18 12:16
能用就用24呗。24核以内的并行效率都不错。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2019-11-18 12:36

alystone 发表于 2019-11-18 12:16
能用就用24呗。24核以内的并行效率都不错。

相比一次提交3个任务、每个任务8核，一次用24核的跑一个任务的效率是差不多的吗？

作者
Author: niobium 时间: 2019-11-18 12:42

wrtgcn 发表于 2019-11-18 12:36
相比一次提交3个任务、每个任务8核，一次用24核的跑一个任务的效率是差不多的吗？

当然8*3更好，前提是内存够用。这是并行的常识

作者
Author: alystone 时间: 2019-11-18 12:44

wrtgcn 发表于 2019-11-18 12:36
相比一次提交3个任务、每个任务8核，一次用24核的跑一个任务的效率是差不多的吗？

差别不大，我好想看过一个G16的并行测评，30核以内近似直线，30核以后的并行效率变差。也就是说同一个节点内，30核以内，两种方法相差无几。不要在意这些，计算时间差一两个小时无所谓，化学信息分析出来就什么都值了。

作者
Author: wrtgcn 时间: 2019-11-18 13:57

alystone 发表于 2019-11-18 12:44
差别不大，我好想看过一个G16的并行测评，30核以内近似直线，30核以后的并行效率变差。也就是说同一个节 ...

好的，谢谢啦

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-18 14:10

wrtgcn 发表于 2019-11-18 12:36
相比一次提交3个任务、每个任务8核，一次用24核的跑一个任务的效率是差不多的吗？

只有24核，没必要拆成多个，虽然对于某些任务可能能榨出一些油水，但是还得折腾，可能由于交接提交反倒浪费时间；而且对于一些内存、硬盘I/O量较大的任务，还可能造成资源争抢而拖慢速度，得不偿失。

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