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标题: MOPAC 2019发布了 [打印本页]

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Accelerator    时间: 2019-11-21 11:39
标题: MOPAC 2019发布了
今天用MOPAC时提示版本过期,才发现MOPAC更新了。
有了一个色彩丰富的主页(https://www.scm.com/doc/MOPAC/index.html)。
更新内容:
• MOPAC has been fully integrated as an Engine in the Amsterdam Modeling Suite; this significantly speeds upthe execution of MOPAC via AMS.
• Parallel binaries.New input options (also available via the Graphical User Interface):
• Calculation of pKa (page 5)
• COSMO (page 4): all solvents available in ADF/Band are now also available in MOPAC.
• Static polarizability tensor (page 5)
• External electric filed (page 4)
• Localized orbitals (Natural Bond Orbitals)
• SCF options (page 6): Camp-King converger, ...
感觉没有什么意义较大的更新;计算pKa看着有点意思,一看手册原来是写上这个关键词后将给出每个与O相连的H的pKa,不能用在其他地方,也不知道精度如何。
不过对于常见有机分子这些现代半经验方法精度还是不错的,算热力学有时比M06-2X/def2-TZVP还好。

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Novice    时间: 2019-11-21 13:37
官网 http://openmopac.net/ 没有更新啊,是不是就是AM$自己更新了一些特性啊
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sobereva    时间: 2019-11-21 17:29
没什么有意义的更新
pka计算功能在之前的MOPAC里就已经有了
算热力学比M06-2X/def2-TZVP还好基本上属于巧合,算一下R^2就露陷了
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星斗如盘    时间: 2021-8-10 17:47
即使算热力学有时比M06-2X/def2-TZVP还好,也不敢直接使用吧?我始终觉得半经验法很鸡肋,预优化结构的确可以减少DFT的时间,但是增加了自己的工作时间,不如直接无脑DFT。预优化过渡态的话,复杂一点的过渡态很多半经验的方法给出来的结构偏差很远。
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sobereva    时间: 2021-8-10 18:13
星斗如盘 发表于 2021-8-10 17:47
即使算热力学有时比M06-2X/def2-TZVP还好,也不敢直接使用吧?我始终觉得半经验法很鸡肋,预优化结构的确可 ...

半经验预优化主要适合初始结构和实际偏离很大,而且是有机类体系

其它情况要么预优化多此一举,要么预优化完了也不靠谱

“算热力学有时比M06-2X/def2-TZVP还好”这种纯巧合、运气性质的现象没有实际指导意义

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星斗如盘    时间: 2021-8-10 18:58
sobereva 发表于 2021-8-10 18:13
半经验预优化主要适合初始结构和实际偏离很大,而且是有机类体系

其它情况要么预优化多此一举,要么预 ...

所以半经验方法只要方便结构优化就可以了,其他的功能确实很鸡肋。我有段时间做优化时,很多初始结构都用xtb预优化一下,后面发现太浪费时间了。
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喵星大佬    时间: 2021-8-11 05:18
本帖最后由 喵星大佬 于 2021-8-11 05:20 编辑
星斗如盘 发表于 2021-8-10 18:58
所以半经验方法只要方便结构优化就可以了,其他的功能确实很鸡肋。我有段时间做优化时,很多初始结构都用 ...

这也是我之前说Dmol这种算孤立体系功能又弱又贵的玩意唯一稍微有点用的地方,用社长的话说就是只能做粗放型研究。单说大的体系(100+原子)优化这事情确实非常的快,结果可靠性也远高于半经验类方法,好歹是正经dft,而且算这种体系甚至只需要稍好一点的办公电脑都可以获得相当不错的速度,操作起来还相当方便。虽说不太对的起那价格,但是如果已经买了还是要物尽其用嘛,何况要是白嫖的话




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