计算化学公社

标题: 不同方法、基组下的势垒计算误差的总结 [打印本页]

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-8-2 06:27
标题: 不同方法、基组下的势垒计算误差的总结
本帖最后由 liyuanhe211 于 2018-6-8 14:34 编辑

Sob之前提供了一篇由Truhlar发表在JCTC上的文献 (J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 808–821)，使用一个Database测试了各方法、基组对势垒计算结果误差的影响；随后讨论到在6-31G(d,p)上增加弥散函数对结果的影响，于是希望总结成一个更直观的表来观察，花了一些时间做出来了，与大家分享。

表中我自己定义了一个因子来描述一个level的“性价比”，考虑到降低一定的误差需要多花费的时间一般是指数增长的，故我定义“性价比” 为 exp(Error)/Time，并按其作表、排序：

图中作者推荐的方法和基组已经标出，可以看出这个“性价比”参数的描述还是比较合适的。也可以看到6-31+G(d,p)基组的“性价比”远远高于6-31G(d,p)和6-31G(d)
该图中节选掉了一些作者只试了有限的几个组合的方法和基组（一大行只有一个数），否则表格太大了
完整的List见下：

原始的误差、时间和“性价比”（均按照原作者所尝试的组合数进行排序并截断）表格如下：

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-8-2 06:47
本帖最后由 liyuanhe211 于 2018-6-8 14:35 编辑

更正：图中的所有能量单位均为kCal/mol

看不清图的-->无损的PNG可以从这里访问、下载：（论坛上不能传，放到组里的网站后台了，可放心访问）

http://old.chem.pku.edu.cn/zyang/BackEnd/Private/BarrierHeightErrorTime.png
http://old.chem.pku.edu.cn/zyang/BackEnd/Private/BarrierHeightErrorEfficiency.png
http://old.chem.pku.edu.cn/zyang/BackEnd/Private/BarrierHeightErrorEfficiencySort.png
http://old.chem.pku.edu.cn/zyang/BackEnd/Private/BarrierHeightErrorError.png
http://old.chem.pku.edu.cn/zyang/BackEnd/Private/BarrierHeightErrorList.png

作者
Author: sobereva 时间: 2015-8-2 12:34
很好。

原文里那个表格弄得不理想，乱七八糟组合的结果只是按误差排序往那里一摆，横向对比很不方便。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-8-7 02:17
本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-8-7 02:28 编辑

lindlar 发表于 2015-8-6 23:22
学习啦！！！！

你有意思嘛？
如图：
(, 下载次数 Times of downloads: 90)

作者
Author: sobereva 时间: 2015-8-7 20:40

liyuanhe211 发表于 2015-8-7 02:17
你有意思嘛？
如图：

总有人为了凑积分短期内大量灌水，已经警告之，再灌就封号

作者
Author: daodaoliu 时间: 2016-2-1 19:38
好东西

作者
Author: 一颗赛艇 时间: 2016-9-13 20:04
本帖最后由一颗赛艇于 2016-9-13 20:35 编辑

要是能有excel方便查找就好了。

而且没有def/def2基组，LanL2DZ什么的，感觉有点遗憾。

有部分居然是高斯03算的，不怕找麻烦？

作者
Author: lc_tw 时间: 2016-11-24 13:34
要是能有excel方便查找就好了。不过还是很感谢！

作者
Author: 一颗赛艇 时间: 2018-6-8 07:21
李老师，图全挂了

作者
Author: Accelerator 时间: 2018-6-8 07:56
图全挂了+1

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2018-6-8 14:35

一颗赛艇发表于 2018-6-8 07:21
李老师，图全挂了

已修复

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2018-6-8 14:35

Accelerator 发表于 2018-6-8 07:56
图全挂了+1

已修复

作者
Author: 1130240115 时间: 2018-6-8 18:12
李老师，为何我进不去您给的网站呢？

作者
Author: yuying348 时间: 2019-8-13 00:52

李老师，为何我进不去您给的网站呢？

作者
Author: NCNG 时间: 2023-7-27 09:56
李老师，图和网站全挂了

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-7-27 14:38
看不到图。。。

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