计算化学公社

标题: 异丙醇脱氢过渡态结构的构建问题 [打印本页]

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朱陈    时间: 2019-11-25 10:47
标题: 异丙醇脱氢过渡态结构的构建问题
C:\Users\DELL\Desktop (, 下载次数 Times of downloads: 15) (, 下载次数 Times of downloads: 17) (, 下载次数 Times of downloads: 14)
在初猜结构中,我试着拉长1号碳和6号氢之间的距离,以这个作为我的初猜结构。输入文件是#p opt=(calcfc,ts,noeigen) freq b3lyp/6-311g** em=gd3
结果也有一个虚频,但是振动方向不是我想要的6号氢原子脱离1号碳原子。所以我又一下几个问题,还望各位老师解答
1. 我拉长碳和氢之间的距离构建初猜结构的方式正确吗
2.这个虚频是不是意味着可能存在过渡态
3.如果我构建的结构是对的,那这个振动方向是对的吗
麻烦各位老师指教,本人刚结束量化,问的可能有点low,还望各位见谅

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lidocaine39    时间: 2019-11-25 11:07
看起来像是甲基旋转的过渡态
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sobereva    时间: 2019-11-25 19:01
你想找的那个脱氢过程根本就没有过渡态,单纯的共价键断裂,几乎一律都是能量单纯升高的

你图里那个虚频对应的是甲基旋转的过渡态

作者
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朱陈    时间: 2019-11-26 11:41
sobereva 发表于 2019-11-25 19:01
你想找的那个脱氢过程根本就没有过渡态,单纯的共价键断裂,几乎一律都是能量单纯升高的

你图里那个虚频 ...

非常感谢sob老师的回复,请问老师结构中羟基的H和氧断裂存在过渡态吗,因为我知道异丙醇脱氢会生成丙酮,所以想找具体脱哪一个氢,并寻找过渡态。麻烦老师帮忙答疑。再次谢谢老师
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sobereva    时间: 2019-11-26 23:31
朱陈 发表于 2019-11-26 11:41
非常感谢sob老师的回复,请问老师结构中羟基的H和氧断裂存在过渡态吗,因为我知道异丙醇脱氢会生成丙酮, ...

不存在
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朱陈    时间: 2019-11-27 19:27
sobereva 发表于 2019-11-26 23:31
不存在

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老师,后面我想应该是8号和10号的氢脱去生成丙酮,所以我做了一个柔性扫描,关键词是pm6 opt=modredundant nosymm
然后报错link 9999, 我想请问老师可以用这个scan扫描的能量最高的作为我的过渡态的初猜结构吗?麻烦老师您了

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Accelerator    时间: 2019-11-27 20:11
你确定异丙醇无催化剂能脱氢?
协同脱去H2的过渡态结构显然不合理 对称性禁阻
如果是专门研究几千摄氏度下的反应则另说
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sobereva    时间: 2019-11-28 02:15
朱陈 发表于 2019-11-27 19:27
老师,后面我想应该是8号和10号的氢脱去生成丙酮,所以我做了一个柔性扫描,关键词是pm6 opt=modredund ...

可以尝试




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