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标题: 求助，输出中间体及过渡态的能量。 [打印本页]

作者
Author: 明园 时间: 2019-11-25 17:13
标题: 求助，输出中间体及过渡态的能量。
本帖最后由明园于 2019-11-25 17:15 编辑

社长，#p opt freq wb97xd/genecp scrf=(smd,solvent=toluene)，在这个级别下优化完中间体后，首先查看了.log的HF=电子能量，但查过一些文献后，发现文献中用的都是吉布斯自由能，遂改为输出了sum of electronic and thermal Free energies=吉布斯自由能，但发现两个能量几乎相同，请问这是正确的吗？（之前上课记得HF能量是从log文件末得到的，但是我是从文件最后一大段数字中找到的，不知这样是否正确）（附件是举了一个中间体的例子，感谢指正）

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-25 18:56
并不几乎相同，差值转化成热力学数据常用的kJ/mol单位一点都不小

作者
Author: 明园 时间: 2019-11-25 20:09
本帖最后由明园于 2019-11-25 20:11 编辑

sobereva 发表于 2019-11-25 18:56
并不几乎相同，差值转化成热力学数据常用的kJ/mol单位一点都不小

好的谢谢社长，社长，还要麻烦您一下，在这个级别下结构优化中间体时，我直接取得sum of electronic and thermal Free energies，但是优化过渡态时，级别是#p opt=(calcall,ts,noeigen) freq pm6 scrf=(smd,solvent=toluene)，发现能量和中间体相差极大，社长，请问是不是不同级别的优化不能拿在一起比较？(过渡态不加热校正量可以吗？)
不好意思社长，我把上传的东西上传到这个对话框里了，我不知道怎么删除了。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-26 23:29

明园发表于 2019-11-25 20:09
好的谢谢社长，社长，还要麻烦您一下，在这个级别下结构优化中间体时，我直接取得sum of electronic and ...

PM6给的自由能垃圾得根本没法用，更何况此体系里有Pd，半经验更是难给出定性正确的数据
PM6只适合找个初猜结构，之后必须拿DFT进一步opt freq

作者
Author: 明园 时间: 2019-11-27 10:01

sobereva 发表于 2019-11-26 23:29
PM6给的自由能垃圾得根本没法用，更何况此体系里有Pd，半经验更是难给出定性正确的数据
PM6只适合找个初 ...

好的谢谢社长。

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