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标题: 求助:获得分子的2D指纹图后如何获得各个键的百分比呢 [打印本页]

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liyunlu    时间: 2019-12-1 14:10
标题: 求助:获得分子的2D指纹图后如何获得各个键的百分比呢
请问各位老师,在获得分子的2D指纹图后如何获得各个键的百分比呢。


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sobereva    时间: 2019-12-2 01:25
我不晓得“键的百分比”怎么定义
如果是指特定原子间接触对应的Hirshfeld表面的面积,用Multiwfn做Hirshfeld surface分析就可以得到(必须用今日刚更新的Multiwfn,手册也是)。Multiwfn手册4.12.6节有Hirshfeld surface分析的具体例子,特别是这段内容跟你的问题相关

(, 下载次数 Times of downloads: 65)

一些相关操作看
使用Multiwfn结合VMD绘制Hirshfeld surface图分析分子晶体中的弱相互作用
https://www.bilibili.com/video/av35738671/


2024-Feb-16补充:看下文,介绍了怎么一次性得到所有元素之间接触的面积
使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用
http://sobereva.com/701http://bbs.keinsci.com/thread-43178-1-1.html



作者
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liyunlu    时间: 2019-12-2 20:55
sobereva 发表于 2019-12-2 01:25
我不晓得“键的百分比”怎么定义
如果是指特定原子间接触对应的Hirshfeld表面的面积,用Multiwfn做Hirshfe ...

file:///C:/Users/liyun/Desktop/2.png
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liyunlu    时间: 2019-12-2 20:58
sobereva 发表于 2019-12-2 01:25
我不晓得“键的百分比”怎么定义
如果是指特定原子间接触对应的Hirshfeld表面的面积,用Multiwfn做Hirshfe ...

谢谢老师的回答,我把文献中对弱相互作用的统计重新添加进来了。
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sobereva    时间: 2019-12-3 06:37
liyunlu 发表于 2019-12-2 20:55

图片没显示出来,传图方式注意看置顶的新社员必读
作者
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liyunlu    时间: 2019-12-3 08:56
谢谢老师,我知道怎么加载了。就是这图c所示。


作者
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努力的小青年    时间: 2021-12-16 15:53
老师,想知道2D指纹图怎么做的

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sobereva    时间: 2021-12-24 02:26
努力的小青年 发表于 2021-12-16 15:53
老师,想知道2D指纹图怎么做的

Multiwfn手册4.12.6节都写明了,仔细看前面我的回复




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