计算化学公社

标题: 求助：dssp计算问题 [打印本页]

作者
Author: wh.shen 时间: 2019-12-2 21:28
标题: 求助：dssp计算问题
本帖最后由 wh.shen 于 2019-12-2 21:38 编辑

各位老师：
我用dssp计算得到的结果想要处理一下，但是发现dssp程序输出的xpm文件中残基数少于top文件中的残基数目，是有些残基没有参与运算吗？top文件中有7178个残基，而dssp计算的是6992个残基，暂时没有解决思路。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-3 06:33
也许是某些残基没有被认成蛋白质
可以尝试改用VMD的timeline插件得到和dssp类似的二级结构 vs.时间的图

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