计算化学公社

标题: 怎么优化WB97XD里面的W值？ [打印本页]

作者
Author: Babily777 时间: 2019-12-3 20:26
标题: 怎么优化WB97XD里面的W值？
The ground-state geometries of the molecules were initially optimized at the B3LYP/cc-pVDZ level of theory. Then, the tuning procedure based on the range-separated (RS) functional (ωB97X) with the cc-pVDZ basis set was performed to obtain the optimal ω values for these geometries; the geometries were then reoptimized using the new ω values.This procedure was iterated until the change in ω became
<10-3 Bohr-1.

文献上写了步骤我确看不懂

求各位大神帮忙！

作者
Author: snljty 时间: 2019-12-3 20:51
参考卢老师的http://sobereva.com/346。

作者
Author: Babily777 时间: 2019-12-3 20:56

snljty 发表于 2019-12-3 20:51
参考卢老师的http://sobereva.com/346。

我不想用这个，用最原始的方法怎么做呢？

作者
Author: pwzhou 时间: 2019-12-3 21:47

Babily777 发表于 2019-12-3 20:56
我不想用这个，用最原始的方法怎么做呢？

不想用别人写好的现成的程序，那就自己写一个，算法是很简单的，你也可以手动一个一个算，不嫌麻烦的话

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-4 04:30

Babily777 发表于 2019-12-3 20:56
我不想用这个，用最原始的方法怎么做呢？

完全意义不明。显然作者是自己写程序实现，要么厚脸皮找作者要程序，要么自己写
如果连文中的描述都尚且看不懂，自己写出程序的可能性为0

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2019-12-4 08:15
本帖最后由让你变成回忆于 2019-12-5 20:55 编辑

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作者
Author: Babily777 时间: 2019-12-4 12:40

让你变成回忆发表于 2019-12-4 08:15
你用sob老师写的这个程序，然后再写一个简单的shell程序就很容易实现了。
文中的意思是先优化结构->在该结 ...

第二步在该结构下优化W怎么实现的呢？WB97XD默认的W是0.2啊，我的命令行输入什么关键字才能改变这个值呢？

作者
Author: Babily777 时间: 2019-12-4 12:47

sobereva 发表于 2019-12-4 04:30
完全意义不明。显然作者是自己写程序实现，要么厚脸皮找作者要程序，要么自己写
如果连文中的描述都尚且 ...

那如果用您写的那个程序，能实现如下操作吗？
an iteration procedure was used to non-empirically tune the ω parameter with the implicit consideration of the dielectric environment via the polarizable continuum model (PCM); the dielectric constant ε was chosen to be 4.0, a representative value of nonpolar organic semiconductor materials.
我的意思是在优化W的时候可以加入介电常数的影响吗？

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2019-12-4 13:40

Babily777 发表于 2019-12-4 12:40
第二步在该结构下优化W怎么实现的呢？WB97XD默认的W是0.2啊，我的命令行输入什么关键字才能改变这个值呢 ...

你仔细读完sob老师上面的那个博文，你就知道怎么设置关键词修改w参数了；
你下面的问题，就是所谓的优化w的过程在PCM下进行，在关键词部分加入对应的溶剂信息即可。

作者
Author: Babily777 时间: 2019-12-4 14:49

让你变成回忆发表于 2019-12-4 13:40
你仔细读完sob老师上面的那个博文，你就知道怎么设置关键词修改w参数了；
你下面的问题，就是所谓的优化 ...

用IOp 3/107和3/108可以自定义W，但是怎么进行优化呢? 应该是输出文件里给我一个W而不是我自己去定义一个W啊？

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2019-12-4 15:39

Babily777 发表于 2019-12-4 14:49
用IOp 3/107和3/108可以自定义W，但是怎么进行优化呢? 应该是输出文件里给我一个W而不是我自己去定义一个 ...

你还是去仔细多读几遍上面的博文吧

作者
Author: leebo 时间: 2019-12-4 18:12

Babily777 发表于 2019-12-4 14:49
用IOp 3/107和3/108可以自定义W，但是怎么进行优化呢? 应该是输出文件里给我一个W而不是我自己去定义一个 ...

u can u up

作者
Author: Babily777 时间: 2019-12-4 18:31

leebo 发表于 2019-12-4 18:12
u can u up

还是没弄明白，心塞

作者
Author: leebo 时间: 2019-12-5 12:05

Babily777 发表于 2019-12-4 18:31
还是没弄明白，心塞

别人给你的意见你都不做，怎么弄明白。更何况现成的程序你都不用，要人家怎么帮你。难道要人家把所有的数据都处理好，再把文章写好，只等文章接收，挂你为一作吗？伸手党。

作者
Author: Babily777 时间: 2019-12-5 13:39
本帖最后由 Babily777 于 2019-12-5 16:09 编辑

leebo 发表于 2019-12-5 12:05
别人给你的意见你都不做，怎么弄明白。更何况现成的程序你都不用，要人家怎么帮你。难道要人家把所有的数 ...

我做了，也做出来了。现成的程序我不用是因为我担心不符合我的体系。非常感谢您的关心呢！
世界如此美好，你却如此刻薄，何必呢？我吃你家大米了吗？

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2019-12-5 13:44

leebo 发表于 2019-12-5 12:05
别人给你的意见你都不做，怎么弄明白。更何况现成的程序你都不用，要人家怎么帮你。难道要人家把所有的数 ...

说实话，我认为上面的博文也已经写得够清楚了，至于还不明白，就正如sob老师所说的，可能不太适合计算化学这个领域。

作者
Author: Babily777 时间: 2019-12-5 16:11

让你变成回忆发表于 2019-12-5 13:44
说实话，我认为上面的博文也已经写得够清楚了，至于还不明白，就正如sob老师所说的，可能不太适合计算化 ...

谢谢您的关心和抬爱呢！我用博文里的方法做了，只是结果不对，我需要做调整。祝您工作顺利，身体健康，一辈子不会遇到解决不了的问题呢！

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