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标题: Kisthelp中如何使用一维阻尼转子进行速率常数校正? [打印本页]

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jing-quan63    时间: 2019-12-8 20:06
标题: Kisthelp中如何使用一维阻尼转子进行速率常数校正?
大家好:
  在计算速率常数的过程中,对于低频的内部扭转必须进行特殊处理,常见方式是采用一维阻尼转子,很多文章都是对低频扭转进行势能面扫描,我想问问在使用Kisthelp计算速率常数时,是如何将扫描势能面和转动惯量放置于输入文件中的,换句话说:Kisthelp中如何使用一维阻尼转子进行速率常数校正?
  谢谢大家!

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sobereva    时间: 2019-12-8 20:36
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”要素及具体内容(仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的标题“Kisthelp计算速率常数”改了,以后务必注意,下次将扣分处理。
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sobereva    时间: 2019-12-8 20:45
那叫受阻(hindered),不叫阻尼(damping)

仔细看此页面,说了考虑受阻转子的时候输入文件怎么写
http://kisthelp.univ-reims.fr/us ... olecularSystem.html
只需要势垒,不牵扯势能面扫描
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jing-quan63    时间: 2019-12-9 09:02
sobereva 发表于 2019-12-8 20:45
那叫受阻(hindered),不叫阻尼(damping)

仔细看此页面,说了考虑受阻转子的时候输入文件怎么写

谢谢老师,我看好几篇文章都是柔性扫描扭转键获得的,请问势垒 还能用什么方式得到?
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sobereva    时间: 2019-12-14 11:25
jing-quan63 发表于 2019-12-9 09:02
谢谢老师,我看好几篇文章都是柔性扫描扭转键获得的,请问势垒 还能用什么方式得到?

扫描可以获得
要么找二面角旋转的过渡态,跑IRC,找到两边的极小点计算能量差




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