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标题: gromacs中，分析结构相关性质时，如何选择构象？ [打印本页]

作者
Author: xiaos 时间: 2019-12-11 19:37
标题: gromacs中，分析结构相关性质时，如何选择构象？
本帖最后由 xiaos 于 2019-12-11 19:47 编辑

老师们好，成品模拟结束后，（1）如何选择用于后续结构相关性质分析的分子构象？是选择成品模拟输出的最后一帧还是有其他做法？（2）在gromacs中对某一段稳定的轨迹按一定时间间隔进行能量分解分析时，最终获得的不同能量项对应的能量应如何处理（取平均值？）？请各位老师指点一下，非常感谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-13 22:58
1 看具体体系具体问题，没法一概而论

2 通常取平均值

作者
Author: xiaos 时间: 2019-12-14 09:46

sobereva 发表于 2019-12-13 22:58
1 看具体体系具体问题，没法一概而论

2 通常取平均值

谢谢sob老师的解答

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