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标题: 教程2（DPPC膜中的KALP15）里的力场问题求助 [打印本页]

作者
Author: zxmxyh 时间: 2019-12-13 14:04
标题: 教程2（DPPC膜中的KALP15）里的力场问题求助
在教程2里，把gromacs自带的gromos53a力场用lipid.itp进行了修改。
但是我看这个网站的介绍，lipid.itp是基于gromos87，而gromos53a基于的是gromos96，这样做没问题吗？

http://wcm.ucalgary.ca/tieleman/downloads

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-13 18:49
注意标题命名需要清楚明白，“Tutorial2里的力场问题”这个标题别人看了根本不知道Tutorial2指的是什么。应当重新修改标题，并且在帖子内容里把tutorial说清楚，至少给出链接

基于GROMOS87的Berger膜力场早就过时了，不应当再去使用。要用就用这些
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作者
Author: zxmxyh 时间: 2019-12-13 19:04

sobereva 发表于 2019-12-13 18:49
注意标题命名需要清楚明白，“Tutorial2里的力场问题”这个标题别人看了根本不知道Tutorial2指的是什么。应 ...

已修改。

今天刚看了一篇文献用了Berger的GROMOS96-54a7，可能没有你给的力场好，但是感觉也被承认？
https://pubs.rsc.org/en/content/ ... 08104e#!divAbstract

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-13 21:19

zxmxyh 发表于 2019-12-13 19:04
已修改。

今天刚看了一篇文献用了Berger的GROMOS96-54a7，可能没有你给的力场好，但是感觉也被承认？
...

Berger根本就不兼容GROMOS96

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