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标题: Gromacs模拟离子液体体系出现Fatal error求助 [打印本页]

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小和尚    时间: 2019-12-19 10:57
标题: Gromacs模拟离子液体体系出现Fatal error求助
本人初学分子动力学模拟,使用Gromacs模拟离子液体体系,力场为OPLS,加入L-J参数, top文件中包含了中BMIM阳离子包含两个拓扑文件,如下

[defaults]
;nbfunc comb-rule gen-pairs fudgeLJ fudgeQQ
1           3        yes        0.5     0.5
;;;LOAD ATOM TYPES
#include "BMIM.itp"
#include "BMIM_atomtypes.itp"


进行mpp处理时会报以下错误,

Fatal error:
Syntax error - File BMIM.itp, line 5
Last line read:
'[ moleculetype ]'
Invalid order for directive moleculetype

请问这种问题应改怎么解决呢?非常感谢!!!

作者
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sobereva    时间: 2019-12-19 15:18
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出具体内容(仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的不恰当标题“求助 Fatal error”改了,以后务必注意
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sobereva    时间: 2019-12-19 15:19
把#include "BMIM_atomtypes.itp"挪到#include "BMIM.itp"前头去
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小和尚    时间: 2019-12-19 16:54
sobereva 发表于 2019-12-19 15:18
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出具体内容(仔细看http://bbs ...

抱歉,不会有下一次了
作者
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小和尚    时间: 2019-12-19 16:54
sobereva 发表于 2019-12-19 15:19
把#include "BMIM_atomtypes.itp"挪到#include "BMIM.itp"前头去

非常感谢呀!!!




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