计算化学公社

标题: HO2、OH对戊醇氢提取的络合物判断与寻找请教 [打印本页]

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Author: jing-quan63 时间: 2019-12-19 11:08
标题: HO2、OH对戊醇氢提取的络合物判断与寻找请教
本帖最后由 jing-quan63 于 2019-12-19 15:47 编辑

大家好：
最近在计算HO2、OH对戊醇氢提取反应速率，对类似体系，通常存在络合物，有以下问题请教：
1：如何判断当前体系有无络合物存在？是否存在类似T1诊断值的判断标准？
2：如何确定络合物结构，听说可以把IRC走得充分后，取两端结构进行优化，低于反应物或者产物能量的结构就是RC和PC，那么，走多长才叫充分呢？
谢谢大家！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-19 15:19
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”要素（仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），我已把你的不恰当标题“络合物判断与寻找”改了，以后务必注意

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-19 15:26
放在一起做几何优化便知，优化出的结构里只要二者没有形成化学键就算形成了复合物。是否成键可以根据下文判断
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

优化完了自然就得到了复合物结构。
先找过渡态再走IRC，对两端结构进行几何优化亦可得到，而且这样可以确保对应的是和过渡态直接相连的极小点
走默认的步数就够了，极个别情况如果发现优化到诡异结构去，可以让IRC跑几十步

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-12-19 15:45

sobereva 发表于 2019-12-19 15:26
放在一起做几何优化便知，优化出的结构里只要二者没有形成化学键就算形成了复合物。是否成键可以根据下文判 ...

好的，非常感谢卢老师！

作者
Author: NHX 时间: 2025-8-25 21:38

sobereva 发表于 2019-12-19 15:26
放在一起做几何优化便知，优化出的结构里只要二者没有形成化学键就算形成了复合物。是否成键可以根据下文判 ...

sob老师您好，我不是专门学化学的，基础不是特别好，因为确定产物结构对于我的研究十分重要，在此有一个问题困扰了很久，想请教一下sob老师。
如果我事先拿到一个反应A+B，我不知道会生成什么产物，但是我推测可能会生成C+D，随后通过找过渡态，跑了IRC后，那么对IRC产物端进行优化得到的是产物复合物，通过您的博文http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html，判断出这个产物复合物C和D之间是成键的(即C-D)，那么当前的这个产物复合物就是最终的产物吗(即A+B生成的是C-D，C和D是成键连在一起的)？还是说当前结构只是表明C、D之间存在相互作用，最终的产物是C和D的单体呢？先谢谢sob老师了。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-8-26 05:56

NHX 发表于 2025-8-25 21:38
sob老师您好，我不是专门学化学的，基础不是特别好，因为确定产物结构对于我的研究十分重要，在此有一个 ...

可能只是中间体，没准最后还可以进一步解离成C和D，这需要计算解离势垒判断是否容易解离

作者
Author: NHX 时间: 2025-8-26 07:13

sobereva 发表于 2025-8-26 05:56
可能只是中间体，没准最后还可以进一步解离成C和D，这需要计算解离势垒判断是否容易解离

好的，感谢sob老师

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