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标题: GROMACS2019.3可以自动调整库仑力截断距离? [打印本页]

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FMGwenyanhoon    时间: 2019-12-23 17:38
标题: GROMACS2019.3可以自动调整库仑力截断距离?
我之前用2018.4计算某体系时,阶段距离设置为1nm(如图一)。后面逛街的时候看到sobereva的windows原生编译的文章又出现了,就出于玩乐心态的把2019.3cuda版本安装了,而且续算了上述体系,然后就出现了图二,现在计算还没结束,就想问问各位,这个是算到半截发现我的初始截断距离设置不合理,自动帮我改了是吗?

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FMGwenyanhoon    时间: 2019-12-23 17:52
算完看了一下.log文件,并没有什么东西改成了1.25,计算参数设置和最开始一样,不知道上图二的那行字是啥意思
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sobereva    时间: 2019-12-23 18:20
程序是在测试最佳的rcoulomb和PME倒易空间计算部分的傅里叶格点数的搭配,在保证误差不变大的情况下寻找效率最高的组合。你不用管。
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FMGwenyanhoon    时间: 2019-12-23 18:38
sobereva 发表于 2019-12-23 18:20
程序是在测试最佳的rcoulomb和PME倒易空间计算部分的傅里叶格点数的搭配,在保证误差不变大的情况下寻找效 ...

明白了,谢谢您!!!




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