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标题: tleap时bond命令报错 [打印本页]

作者
Author: DoubeeTwT 时间: 2019-12-23 21:31
标题: tleap时bond命令报错
本帖最后由 DoubeeTwT 于 2019-12-23 21:33 编辑

现有一自己搭建的体系每一个单一单元都已经完成了自建立场，也可以tleap成功，但这样的结构在计算中会整体散架（因为缺少bond，这个我知道了）
查询amber手册给出的例子是：
bond trx.32.SG trx.35.SG

于是仿照写下：
bond PDB.1.O1 PDB.2.C7

但是tleap报错：
bond: Argument #1 is type String must be of type: [atom]
usage: bond <atom1> <atom2> [order]

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-23 23:58
用desc PDB可见，后面序号是从4开始的，所以不能用PDB.1.

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