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标题: 计算Hirshfeld surface的问题 [打印本页]

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2019-12-27 09:50
标题: 计算Hirshfeld surface的问题
用Multiwfn计算Hirshfeld surface的时候，一个目标晶体周围围了10个另一种晶体，在输入目标晶体的原子序号之后，出现了这个界面，是需要用高斯算这十个分子的波函数再上传到Multiwfn去么？我看sob老师的教程，用的直接是一个atomic .wfn 文件（Evaluating atomic densities based on atomic .wfn files）
还有，我的输入文件是xyz格式，不是pdb格式，会影响这个计算的结果么？
感谢老师!

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-27 21:42
手册里4.12.5节有明确说明，不想基于特定级别的自由原子密度进行计算就选1用自带的原子密度就完了，省事得多，结果和选2也没什么显著差别
用xyz和用pdb传递给Multiwfn的信息明显是一样的，因此结果也是完全一样的，看
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379（http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html）

2024-Feb-16补充：如今的Multiwfn做Hirshfeld surface分析的时候已经不需要用户选择用哪种原子密度了，始终会用自带的原子密度。看下文
使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用
http://sobereva.com/701（http://bbs.keinsci.com/thread-43178-1-1.html）

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2019-12-28 09:26

sobereva 发表于 2019-12-27 21:42
手册里4.12.5节有明确说明，不想基于特定级别的自由原子密度进行计算就选1用自带的原子密度就完了，省事得 ...

谢谢老师，问题已经解决了

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