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标题: 磷脂double-bilayer怎么画出漂亮的density profile？ [打印本页]

作者
Author: zxmxyh 时间: 2020-1-2 09:18
标题: 磷脂double-bilayer怎么画出漂亮的density profile？
模拟了100ns的磷脂double-bilayer，想要导出漂亮的density profile. 用了
gmx density -s md_100.tpr -f md_100_whole.xtc -d Z -symm -o EDP.xvg
做出来的效果感觉没有文献的平滑美观，尤其是两个头基的尖峰。如果作平均是不是会丢失分辨率？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-2 18:30
-sl加大点，这样可以让统计的距离间隔变小。
当前间隔太大，自然就显得有锯齿

作者
Author: zxmxyh 时间: 2020-1-2 20:16
感谢！很有效

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