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标题: ORCA安装后运行出错，请大神帮忙看下什么问题，实在搞不定 [打印本页]

作者
Author: noraa 时间: 2020-1-3 16:28
标题: ORCA安装后运行出错，请大神帮忙看下什么问题，实在搞不定
这台机子有intel的编译器，但是我用的是gcc g++ gfotran
出错信息如下：
(, 下载次数 Times of downloads: 31)

which openmpi信息：
[feng@codes test]$ which openmpi
/usr/bin/which: no openmpi in (/opt/intel//impi/5.0.1.035/intel64/bin:/opt/intel//impi/5.0.1.035/intel64/bin:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/mpirt/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/debugger/gdb/intel64_mic/bin:/opt/intel//impi/5.0.1.035/intel64/bin:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/mpirt/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/debugger/gdb/intel64_mic/bin:/opt/intel//impi/5.0.1.035/intel64/bin:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/mpirt/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/debugger/gdb/intel64_mic/bin:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/mpirt/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.0.090/debugger/gdb/intel64_mic/bin:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/home/gauopen:/home/g16/bsd:/home/g16:/home/openmpi314/bin:/home/orca421:/home/feng/.local/bin:/home/feng/bin)

请大家帮助，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-3 17:33
运行which openmpi毫无意义，本来就没有叫openmpi的命令

确保openmpi编译正常，并且用的是当前ORCA兼容的版本。说不清楚就上传输出文件

作者
Author: noraa 时间: 2020-1-20 23:30
本帖最后由 noraa 于 2020-1-20 23:32 编辑

折腾了很久，自己找到原因了，写在帖子里面供大家参考：
1、我这里出现的错误是因为intermpi和openmpi冲突引起的，在/etc/profile 或者用户的.bashrc中注释掉Intel的相关信息后运行无误。
2、我这里也尝试安装了vasp，用的是社长的方法。这个时候orca和vasp只能运行其中一个，即在环境变量设置中注释掉intel的信息，然后运行orca；添加intel的信息，orca死掉，vasp可以运行。很不爽呀，怎么办呢？运行的vasp的时候source一下就可以了，其他的按照orca的要求来，这样稍微麻烦一点，但是不用频繁的改动.bashrc。保证了需要的时候，可以快速的运行其中一个程序。
3、怎么才能使orca和vasp同时运行呢？不要使用intel的编译器和intelmpi？还是有共存的方法？

作者
Author: biogon 时间: 2020-1-21 20:20

noraa 发表于 2020-1-20 23:30
折腾了很久，自己找到原因了，写在帖子里面供大家参考：
1、我这里出现的错误是因为intermpi和openmpi冲突 ...

用两个用户名跑就行了，两个不同的bashrc

作者
Author: abin 时间: 2020-1-22 21:42
Create two scripts.

script_A, for orca.
#!/bin/bash
### something to set the proper openMPI and PATH for orca.
XXXXXX
# command to invoke orca run
XXXXXX

script_B, for vasp
#!/bin/bash
## you may need to set the Intel for VASP
XXXXXXX

### you may need to set PATH for vasp

### write code here to invoke vasp run.

No need to set openMPI or Intel in your ~/.bashrc file.

Create folder_A for orca, copy script_A and your input files to folder_A.
Edit script_A if needed.
bash script_A &
If there is something like PBS, then incorporate script_A to the pbs or slurm script.

Same story for your VASP and script_B.

Any way, please forgive your Windows logic when you are going to try something on Linux platform.

Good luck.

作者
Author: waker 时间: 2022-6-29 21:52

noraa 发表于 2020-1-20 23:30
折腾了很久，自己找到原因了，写在帖子里面供大家参考：
1、我这里出现的错误是因为intermpi和openmpi冲突 ...

你好，我发现我遇到和你一样的问题了，请问一下你的问题解决了吗？另外我是电脑小白，能私信和我说说在window系统下，如何在环境变量设置中注释掉intel的信息吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-6-29 22:12

waker 发表于 2022-6-29 14:52
你好，我发现我遇到和你一样的问题了，请问一下你的问题解决了吗？另外我是电脑小白，能私信和我说说在wi ...

你的windows系统上安装过intel编译器或者intel mpi吗？如果没安装过，那就不存在注释掉intel信息的问题

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