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标题: 求助：是不是结构显示能量不变，温度不变就表示得到的是平衡结构？密度呢？ [打印本页]

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-7 21:00
标题: 求助：是不是结构显示能量不变，温度不变就表示得到的是平衡结构？密度呢？
求助：是不是结构显示能量不变，温度不变就表示得到的是平衡结构？密度呢？

作者
Author: 牧生 时间: 2020-1-7 21:27
比如做自组装模拟的过程，温度和能量都已经基本不变了，但是自组装形态还在继续变化，表明仍未达到平衡。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-7 22:40
论坛首页google框搜“判断平衡”，有大量讨论

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-8 09:28

牧生发表于 2020-1-7 21:27
比如做自组装模拟的过程，温度和能量都已经基本不变了，但是自组装形态还在继续变化，表明仍未达到平衡。

您好但是怎么看形态继续变化呀是看密度没有趋于稳定的趋势么？

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-8 09:28

sobereva 发表于 2020-1-7 22:40
论坛首页google框搜“判断平衡”，有大量讨论

好的谢谢S先生

作者
Author: 牧生 时间: 2020-1-8 16:41

dmpb 发表于 2020-1-8 09:28
您好但是怎么看形态继续变化呀是看密度没有趋于稳定的趋势么？

这个我只晓得计算结束后看轨迹运行来判断，在中间过程我不会看。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-8 21:42
说清楚具体是什么体系，否则都是空谈

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-9 10:16

sobereva 发表于 2020-1-8 21:42
说清楚具体是什么体系，否则都是空谈

是水化硅酸钙周期性体系 emmm我改变了一下控温和控压条件密度变得就非常微小了

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-9 10:16

牧生发表于 2020-1-8 16:41
这个我只晓得计算结束后看轨迹运行来判断，在中间过程我不会看。

可以啊怎么看轨迹呀？我这还不够格传送图片。。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-10 01:56

dmpb 发表于 2020-1-9 10:16
是水化硅酸钙周期性体系 emmm我改变了一下控温和控压条件密度变得就非常微小了

这种体系跑个几百ps一般足够达到平衡了。
轨迹通常用VMD看

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-10 10:47

sobereva 发表于 2020-1-10 01:56
这种体系跑个几百ps一般足够达到平衡了。
轨迹通常用VMD看

好的 sob老师，我还想问下像我刚刚说的结构体系，施加应力会导致结构变形，但是到结构破坏时，也就是零界点，看什么呀？看他的晶胞长度还是密度或者其他呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-11 20:42

dmpb 发表于 2020-1-10 10:47
好的 sob老师，我还想问下像我刚刚说的结构体系，施加应力会导致结构变形，但是到结构破坏时，也就是零 ...

从轨迹上直接就看得出来
要么自己写VMD分析脚本通过一些指标进行判断，比如最大键长随时间变化之类的，能对应上破坏过程的显著变化即可

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-12 23:53

sobereva 发表于 2020-1-11 20:42
从轨迹上直接就看得出来
要么自己写VMD分析脚本通过一些指标进行判断，比如最大键长随时间变化之类的， ...

好的谢谢

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-13 00:00

sobereva 发表于 2020-1-11 20:42
从轨迹上直接就看得出来
要么自己写VMD分析脚本通过一些指标进行判断，比如最大键长随时间变化之类的， ...

VMD怎么进行提取呢？代码咱这边有么？我第一次听说VMD呢

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-13 21:03

dmpb 发表于 2020-1-13 00:00
VMD怎么进行提取呢？代码咱这边有么？我第一次听说VMD呢

公社论坛首页google框搜VMD。sobereva.com右侧选VMD也能看到我之前写的大量相关文章

做动力学的人离不开VMD

作者
Author: dmpb 时间: 2020-1-14 08:50

sobereva 发表于 2020-1-13 21:03
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做动力学的人离不 ...

好的谢谢sobereva老师

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