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标题: 从文献中得到了相应分子的itp文件，怎么获得或是生成分子的pdb文件呢？ [打印本页]

作者
Author: 小和尚 时间: 2020-1-13 10:41
标题: 从文献中得到了相应分子的itp文件，怎么获得或是生成分子的pdb文件呢？
各位老师，同学，我想使用文献中报道的联合原子力场模拟离子液体体系，作者在支持材料中给出了相应的力场文件，想请问一下怎么才能得到相应分子的pdb文件呢？
非常感谢您的回复！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-1-13 20:33
找作者直接要最快

作者
Author: wbn 时间: 2020-1-14 06:09
直接用GaussView 搭一个就可以，注意原子顺序和itp文件对应就可以了。如果有united atom 情况就随便用个其它元素代替，然后在pdb文件里改原子名

作者
Author: 小和尚 时间: 2020-1-15 13:15

wbn 发表于 2020-1-14 06:09
直接用GaussView 搭一个就可以，注意原子顺序和itp文件对应就可以了。如果有united atom 情况就随便用个其 ...

非常感谢！

作者
Author: bobosiji 时间: 2020-1-15 14:57

wbn 发表于 2020-1-14 06:09
直接用GaussView 搭一个就可以，注意原子顺序和itp文件对应就可以了。如果有united atom 情况就随便用个其 ...

good point~

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