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标题: 关于过渡态寻找时的初猜技巧求助 [打印本页]

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Author: Kikyou 时间: 2020-1-15 09:38
标题: 关于过渡态寻找时的初猜技巧求助
请问各位老师，过渡态的初猜结构有没有什么技巧啊，小弟新手小白自学，算了两周了，试了各种摆结构最后结果的虚频总是不按期望，放的太近就直接成键了，然后虚频就是转一些无关紧要的甲基啥的，放太远就直接优化跑了，请教各位这里面有没有什么trick之类的。。。比如成键的原子放多近为好，断键的原子拉多远
小弟算的是一个CO2分子插入Ni-C键的过渡态，感觉断一根键成两根键应该是Ni-C逐渐远离并向CO2的一个羰基的两端靠近的过程，如果是这样的过程的话，虚频应该是怎样振动呢？小弟只算过一些教程类的简单例子像D-A反应这种，感觉在过渡态计算方面还远远没入门。
感觉可能问了一些不太友好的问题，我知道过渡态初猜比较难，可能需要很多的经验和实践才能熟能生巧，不过还是希望各位路过的有经验的老师方便的话能指点一二，拜谢。

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Author: hakuna 时间: 2020-1-15 11:45
高斯外行表示会把那一坨纯C+H弄到近似与杂环一个平面上去，然后考虑TS的事情.....

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Author: 一颗赛艇 时间: 2020-1-15 14:03
做个柔性扫描一了百了

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Author: Kikyou 时间: 2020-1-15 15:10

hakuna 发表于 2020-1-15 11:45
高斯外行表示会把那一坨纯C+H弄到近似与杂环一个平面上去，然后考虑TS的事情.....

好的我试一下看看，谢谢您~

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Author: Kikyou 时间: 2020-1-15 15:11

一颗赛艇发表于 2020-1-15 14:03
做个柔性扫描一了百了

嗯嗯，我也在考虑这个问题了，毕竟摆了好多位置都没找到，谢谢指点~

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Author: sobereva 时间: 2020-1-15 22:51
相关讨论在论坛里有大量，恰当用首页google框搜索，我回复过的找过渡态的问题的帖子也有无数。把那些讨论都看了，怎么做自然心里就有数。有用的技巧都在这些讨论里，论坛现有的帖子是巨大的计算化学资源宝库。

另外，做某个反应之前，一定要用google学术搜索反复尝试搜索相关类型反应的计算文章，有别人的过渡态作为参考，找过渡态会容易得多

碰到难找过渡态的情况，先把反应物和产物结构都优化出来，参照着搞

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Author: Kikyou 时间: 2020-1-19 12:03

sobereva 发表于 2020-1-15 22:51
相关讨论在论坛里有大量，恰当用首页google框搜索，我回复过的找过渡态的问题的帖子也有无数。把那些讨论都 ...

好的，谢谢Sob老师！

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Author: Machaophy 时间: 2020-1-25 00:09
个人是先优化反应物和生成物的结构
然后对比着猜，断键成健的部分都调整改变约1/3左右，然后注意不要有原子之间距离过近，转转二面角啥的
一般就差不多了

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Author: wxy 时间: 2020-1-25 12:05
1）弄明白反应机理；2）优化反应物的结构；3）根据反应机理做柔性扫描；4）对扫描获得的过渡态做优化和频率分析。

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