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标题: 求助关于Sobmecp提示没有原子输入的问题 [打印本页]

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Author: 影后宁 时间: 2020-1-15 09:42
标题: 求助关于Sobmecp提示没有原子输入的问题
最近我在用sobmecp计算势能面交叉点的时候，参照sob老师的帖子，分别设置好了input_header_A,input_header_B,geom,input_tail。然后分别运行。但是算了一步之后，系统就提示B中没有原子输入。难道geom文件里面不是只需要一个重态的分子坐标就够了吗？应该怎么解决呢？

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Author: sobereva 时间: 2020-1-15 22:59
先把自带的例子跑一遍，确保使用流程无误

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Author: 影后宁 时间: 2020-1-19 20:25

sobereva 发表于 2020-1-15 22:59
先把自带的例子跑一遍，确保使用流程无误

sob老师，我用苯基阳离子运算了一遍是可以的，但是用我的结构还是提示这种错误。提示我这个结构没有原子输入，很奇怪。

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Author: sobereva 时间: 2020-1-19 20:35

影后宁发表于 2020-1-19 20:25
sob老师，我用苯基阳离子运算了一遍是可以的，但是用我的结构还是提示这种错误。提示我这个结构没有原子 ...

检查空行。并且注意windows和linux的换行符有异，windows下编辑完的弄到linux下后用dos2unix转换一下确保空行都正常

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Author: 影后宁 时间: 2020-1-19 20:47
好的，老师我试试。

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Author: 影后宁 时间: 2020-1-19 21:12

sobereva 发表于 2020-1-19 20:35
检查空行。并且注意windows和linux的换行符有异，windows下编辑完的弄到linux下后用dos2unix转换一下确保 ...

老师，那么为什么结构A的第一步可以算呢？如果是空格的问题的话？

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Author: 影后宁 时间: 2020-1-29 19:17

sobereva 发表于 2020-1-19 20:35
检查空行。并且注意windows和linux的换行符有异，windows下编辑完的弄到linux下后用dos2unix转换一下确保 ...

老师，我反复尝试了几次，在算完A以后，B就提示没有原子输入，然后运行就终止了。输入文件没有问题，换一个结构就能够运算。

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Author: 影后宁 时间: 2020-1-31 18:37
换了一个重态的结构坐标，就可以解决了。具体原因我也不清楚。

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