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标题: 求助：BF4阴离子的OPLS力场itp文件生成 [打印本页]

作者
Author: sungl123456 时间: 2020-1-15 11:07
标题: 求助：BF4阴离子的OPLS力场itp文件生成
我想模拟溶剂分子包裹一个离子液体阴阳离子的这样的一个体系，离子液体的阴离子是BF4-，阳离子是[OMIM]+，体系中的溶剂分子和阳离子都可以通过LigParGen生成拓扑文件，但是BF4-会报错，我尝试使用acpype也不行，有没有什么方法能够得到BF4在OPLS力场下的itp文件呢

作者
Author: liuyuje714 时间: 2020-1-15 11:59
这种已经有过研究的你最好从文献中去查。
https://github.com/orlandoacevedo/IL?files=1

作者
Author: naoki 时间: 2020-1-15 12:33
GAFF不支持硼，所以acpype不行。楼上这个链接靠谱，是专门为离子液体优化的OPLS-AA的拓扑。两篇原文如下：
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ct900009a
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jctc.7b00520

作者
Author: Frank 时间: 2020-1-15 18:32
也可以用这一个 https://github.com/agiliopadua/ilff

作者
Author: sungl123456 时间: 2020-1-15 18:50

Frank 发表于 2020-1-15 18:32
也可以用这一个 https://github.com/agiliopadua/ilff

有点东西，可以可以

作者
Author: sungl123456 时间: 2020-1-15 18:53

liuyuje714 发表于 2020-1-15 11:59
这种已经有过研究的你最好从文献中去查。
https://github.com/orlandoacevedo/IL?files=1

靠谱，厉害厉害，学到了

作者
Author: sungl123456 时间: 2020-1-15 18:54

naoki 发表于 2020-1-15 12:33
GAFF不支持硼，所以acpype不行。楼上这个链接靠谱，是专门为离子液体优化的OPLS-AA的拓扑。两篇原文如下：
...

厉害厉害，两篇原文我都会看看

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