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标题: fchk文件的转化出错 [打印本页]

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-8-20 10:26
标题: fchk文件的转化出错
我想把所有的xxx.chk文件转化成xxx.fchk然后用multiwfn来计算mayer键级和拉普拉斯值等数据，但是输入命令formchk xxx.chk xxx.fchk后发生错误，如下
[rym@mic fchk]$ formchk xxx.chk xxx.fchk
Read checkpoint file TDA-1-i-liq.chk
Write formatted file TDA-1-i-liq.fchk
Missing data for FChkPn.
Error termination via Lnk1e at Thu Aug 20 17:58:30 2015.

形成的.fchk文件大小为0.
请问这是怎么回事
谢谢老师

作者
Author: sobereva 时间: 2015-8-20 12:45
重新算一下单点重新得到chk再转换看看

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-8-22 09:58

sobereva 发表于 2015-8-20 12:45
重新算一下单点重新得到chk再转换看看

谢谢问题已解决

作者
Author: 王元亮 时间: 2022-1-15 16:11

lastzealot 发表于 2015-8-22 09:58
谢谢问题已解决

您好，我遇到了同样的问题，转换的文件只做了opt与freq，按sob老师的方法是不是要算一下单点能？您看跟您遇到的问题一样吗？期待您的回答

作者
Author: yangxuping 时间: 2022-3-14 14:50

王元亮发表于 2022-1-15 16:11
您好，我遇到了同样的问题，转换的文件只做了opt与freq，按sob老师的方法是不是要算一下单点能？您看跟您 ...

你好，请问你的问题解决了吗？

作者
Author: KangJiaxin 时间: 2022-3-14 15:05

王元亮发表于 2022-1-15 16:11
您好，我遇到了同样的问题，转换的文件只做了opt与freq，按sob老师的方法是不是要算一下单点能？您看跟您 ...

正常结束的文件不应该转化失败，首先确认一下计算是否正常结束，如果是正常结束转化失败，检查一下是不是用的不同的系统，Linux下的chk不能在win下转换，win的chk文件也不能在Linux中转换。这些都没问题就重新算一个单点得到chk

作者
Author: KangJiaxin 时间: 2022-3-14 15:06

yangxuping 发表于 2022-3-14 14:50
你好，请问你的问题解决了吗？

作者
Author: 王若曦 时间: 2022-3-18 20:50
我想知道怎么把fchk文件转化为chk文件，高斯输出结果之后不小心把chk文件删除了

作者
Author: zjxitcc 时间: 2022-3-18 20:54

王若曦发表于 2022-3-18 20:50
我想知道怎么把fchk文件转化为chk文件，高斯输出结果之后不小心把chk文件删除了

unfchk xxx.fchk xxx.chk

作者
Author: 红米饭1234 时间: 2022-3-18 21:54

王若曦发表于 2022-3-18 20:50
我想知道怎么把fchk文件转化为chk文件，高斯输出结果之后不小心把chk文件删除了

有fchk科研不要chk了
可以去回收站找一下

作者
Author: UTM 时间: 2022-5-10 19:47
我在转换过程中发现一个问题是在windows系统向虚拟机里复制chk文件的时候经常发生复制的文件的大小远小于原文件的情况，不知道这个是不是我的虚拟机的问题。使用这样的文件去formchk就会报Missing data for FChkPn的错误。正常复制之后再formchk就没有这个问题了，当然需要注意gaussian的版本问题。（仅提出一种出现这个问题的可能）

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-16 00:08

UTM 发表于 2022-5-10 19:47
我在转换过程中发现一个问题是在windows系统向虚拟机里复制chk文件的时候经常发生复制的文件的大小远小于原 ...

如果是直接拖，大文件极大概率复制不完整
复制 - 粘贴方式向虚拟机传大文件成功率高得多，但是碰上几GB的文件也时不时传不完整
通过共享文件夹，或者sftp等方式传文件，100%能传完整

作者
Author: UTM 时间: 2022-5-16 01:06

sobereva 发表于 2022-5-16 00:08
如果是直接拖，大文件极大概率复制不完整
复制 - 粘贴方式向虚拟机传大文件成功率高得多，但是碰上几GB ...

哦哦学到了，确实每次拖大文件的时候几乎都不完整，得试好多次才能得到完整的，谢谢sob老师的指点，又学了一招。

作者
Author: 不喝可乐 时间: 2022-7-19 09:25

sobereva 发表于 2015-8-20 12:45
重新算一下单点重新得到chk再转换看看

老师，我是刚算出的单点，转化也出现这个问题了，这是啥原因。

作者
Author: yifanwang 时间: 2023-12-3 20:57
求助一下Linux系统下算出的chk文件在win系统下用gaussview转化fchk文件时报错，如何解决：

作者
Author: snljty2 时间: 2023-12-3 21:23

yifanwang 发表于 2023-12-3 20:57
求助一下Linux系统下算出的chk文件在win系统下用gaussview转化fchk文件时报错，如何解决：

本来就不能这么转，Linux下转完了再把fch文件传回来，用GaussView等程序打开。

作者
Author: yifanwang 时间: 2023-12-5 19:49

snljty2 发表于 2023-12-3 21:23
本来就不能这么转，Linux下转完了再把fch文件传回来，用GaussView等程序打开。

谢谢老师帮助，的确需要先在linux服务器上转成fchk文件。

作者
Author: wanwan5339 时间: 2024-4-16 12:00
本帖最后由 wanwan5339 于 2024-4-16 15:01 编辑

sobereva 发表于 2015-8-20 12:45
重新算一下单点重新得到chk再转换看看

请问sob社长，我现在不仅出现上面状况下面还多了一行字Segmentation fault (core dumped)，这是在超算中心上执行的，我不知道如何解决

作者
Author: wanwan5339 时间: 2024-4-16 16:54

wanwan5339 发表于 2024-4-16 12:00
请问sob社长，我现在不仅出现上面状况下面还多了一行字Segmentation fault (core dumped)，这是在超算中 ...

已解决

作者
Author: ｃｌａｒｅ 时间: 2024-5-18 14:39

wanwan5339 发表于 2024-4-16 16:54
已解决

请问是怎么解决的呢？

作者
Author: wanwan5339 时间: 2024-5-18 14:57

ｃｌａｒｅ发表于 2024-5-18 14:39
请问是怎么解决的呢？

我是在超算中心里运行的，需要先进入chk文件所在的文件夹，然后输入转变fchk的命令

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