计算化学公社

标题: AIMD跑纯苯液体应该用什么方法比较好？ [打印本页]

作者
Author: persistence 时间: 2020-2-9 13:32
标题: AIMD跑纯苯液体应该用什么方法比较好？
各位老师好，我想用AMID跑一个纯苯液体，目前查到对纯水有的用PBE0+TS，有的用meta-GGA。本人对这方面完全小白，不太清楚应该用什么方法比较好呀？谢谢各位啦！

作者
Author: biogon 时间: 2020-2-9 14:11
你用周期性软件跑苯液体的AIMD？

作者
Author: bobosiji 时间: 2020-2-9 14:50

biogon 发表于 2020-2-9 14:11
你用周期性软件跑苯液体的AIMD？

能跑水的话，苯为啥不能跑呢?

作者
Author: sobereva 时间: 2020-2-9 14:54
TS色散校正已经过时了
PBE0等杂化泛函在大多数第一性原理程序里比纯泛函明显耗时更高。建议用PBE-D3(BJ)或BLYP-D3(BJ)
meta-GGA是一大类泛函的统称，说这个等于什么也没说
提问时应该说清楚打算用什么程序跑，泛函的选择和程序有很大关系。

作者
Author: biogon 时间: 2020-2-9 15:07

bobosiji 发表于 2020-2-9 14:50
能跑水的话，苯为啥不能跑呢?

如何保证一个能胞正确定性描述液体，这可比描述晶体难多了

作者
Author: persistence 时间: 2020-2-9 17:35

biogon 发表于 2020-2-9 15:07
如何保证一个能胞正确定性描述液体，这可比描述晶体难多了

嗯嗯对的，是想跑一个周期性的苯

作者
Author: persistence 时间: 2020-2-9 17:37

sobereva 发表于 2020-2-9 14:54
TS色散校正已经过时了
PBE0等杂化泛函在大多数第一性原理程序里比纯泛函明显耗时更高。建议用PBE-D3(BJ)或 ...

谢谢sobereva老师，打算用orca跑一下试试，不知道可以不？

作者
Author: biogon 时间: 2020-2-9 18:15

persistence 发表于 2020-2-9 17:37
谢谢sobereva老师，打算用orca跑一下试试，不知道可以不？

orca并不能pbc

作者
Author: sobereva 时间: 2020-2-10 07:05

persistence 发表于 2020-2-9 17:37
谢谢sobereva老师，打算用orca跑一下试试，不知道可以不？

CP2K很适合这种周期性MD问题，又快又免费

作者
Author: persistence 时间: 2020-2-10 13:58

sobereva 发表于 2020-2-10 07:05
CP2K很适合这种周期性MD问题，又快又免费

好的，非常感谢您

作者
Author: persistence 时间: 2020-2-10 14:00

biogon 发表于 2020-2-9 18:15
orca并不能pbc

非常感谢您

作者
Author: coolrainbow 时间: 2020-2-14 11:09
PBE0跑液体，除非你有几千个核随便糟
一般也就PBED3了，CP2K 100个核就已经能跑50ps

作者
Author: bobosiji 时间: 2022-9-6 14:52

biogon 发表于 2020-2-9 15:07
如何保证一个能胞正确定性描述液体，这可比描述晶体难多了

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-9-6 19:56

bobosiji 发表于 2022-9-6 07:52
**** 本内容被作者隐藏 ****

对，对于苯这种体系应该已经有很好的力场了，除非为了炫技或者炫硬件，否则没太大必要跑AIMD，经典MD就够了。
如果研究苯的反应（比如硝化啥的），或者苯的辐射化学，或者苯的激发态化学，那还有必要跑个AIMD看看

作者
Author: k64_cc 时间: 2022-9-7 13:03

bobosiji 发表于 2022-9-6 14:52
**** 本内容被作者隐藏 ****

同时，苯的扩散是非常非常慢的，在AIMD能支持的尺度上很可能什么重要现象都看不到。

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