计算化学公社
标题:
关于虚拟机下进行Gaussian计算核心数的设置问题。
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作者Author:
mapinyi1989
时间:
2020-2-15 12:03
标题:
关于虚拟机下进行Gaussian计算核心数的设置问题。
我的电脑是用的2个E5 2666V3 CPU,总计20个核心,内存128G。主系统Windows server 2016,在V-BOX虚拟机下安装linux,运行Gaussian16 A.03。
我提交计算任务时候给多少核心合适呢?
我测试了小结构的opt运算,发现8核心(线程)运算速度 ≈ 10核心>12核心>14核心,这是什么原因呢。大结构就不会这样了?如果使用8核心运算我可以开两个虚拟机吗?
不知道是我设置的问题,还是虚拟机问题?
还有一个问题,就是计算时间,最后显示的CPU工作时间,无论怎么算也和实际时间对不上。
作者Author:
exity
时间:
2020-2-15 19:08
用8核心也不必开两个虚拟机,开两个高斯进程就行了。
高斯确实有这种现象,小体系分配的核心数太多反而不如例如8核,12核心这样的相对较低的核心数速度快,而大体系(>100 atoms)就不会。
作者Author:
sobereva
时间:
2020-2-16 09:36
G16末尾既给出CPU time也给出wall clock time,显然应当看后者。但后者有时候也不准,最靠谱的是用time命令看
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