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标题: Forcite模块动力学模拟后为什么能量却不发生任何的变化？ [打印本页]

作者
Author: ZZZ2556540 时间: 2020-2-18 17:59
标题: Forcite模块动力学模拟后为什么能量却不发生任何的变化？
建立的模型通过forcite模块进行Geometry Optimization（结构优化）任务之后，再进行Dynamics任务动力学模拟之后，在通过energy任务进行能量计算时，却发现体系的能量以及各个结合能却与动力模拟之前的能量值基本一致。为什么分子动力学模拟之后，能量却不发生任何的变化？分子毕竟产生了运动，也发生了一定的相互作用，能量不应该发生改变吗？
请大神指点一下！！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-2-19 12:31
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”要素及具体内容（仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），我已把你的不恰当标题“MS中Forcite模块动力学模拟”改了，以后务必注意

作者
Author: sobereva 时间: 2020-2-19 12:34
要么算能量用的结构本来就是之前的结构，要么动力学模拟过程中结构就基本没变，仔细看模拟轨迹判断

作者
Author: ZZZ2556540 时间: 2020-2-19 15:01

sobereva 发表于 2020-2-19 12:34
要么算能量用的结构本来就是之前的结构，要么动力学模拟过程中结构就基本没变，仔细看模拟轨迹判断

谢谢sobereva老师，我下次一定注意发帖子的要求。确实动力学模拟之后，结构几乎没发生变化，分子也只是进行了微小的移动，基本上看不出来。您说，会不会跟我模拟设置的时长，精度或者步数的问题？时长太短，精度不够高的原因？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-2-21 19:37
可能模拟时间不够长，或者热浴温度不够高

作者
Author: ZZZ2556540 时间: 2020-2-25 15:35

sobereva 发表于 2020-2-21 19:37
可能模拟时间不够长，或者热浴温度不够高

谢谢sobereva老师的指点！

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