计算化学公社

标题: 为什么OH自由基进攻CF3CBr=CH2会有两个过渡态？ [打印本页]

作者
Author: YjLiu 时间: 2020-2-19 12:28
标题: 为什么OH自由基进攻CF3CBr=CH2会有两个过渡态？
各位老师好，我看到了一个关于过渡态搜寻的文章，原文通过高斯计算，计算级别B3LYP/aug-cc-PVTZ反应是OH自由基进攻CF3CBr=CH2。如下图所示，是OH对Br的取代反应，想请问各位老师为什么这个反应会有两个过渡态。像这类有多个过渡态的反应还可以用TS关键词寻找吗？在什么情况下要考虑这种多种过渡态的情况？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-2-19 12:53
有不同的机理显然对应于不同的过渡态
当然可以用opt=TS，摆成相应的恰当的过渡态初猜就完了
PS：此文用的计算级别非常不合理。用M06-2X/def2-TZVPP不仅便宜得多结果还好的多

求助帖必须在帖子标题明确体现出具体内容（仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），我已把你的不恰当标题“请教各位老师关于过渡态搜寻的问题”改了，以后务必注意

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2020-2-19 13:56
这不宜描述成“有两个过渡态”，让人误以为是个两步基元反应组成的过程。这只是同一类过渡态有两个构象，这太常见了，除了什么三原子体系之类的特简单体系或特刚性体系，几乎都存在这种情况，我最近做的反应同一种键连方式（含哪个键的成键改变了）的一个过渡态有超过300种构象。

作者
Author: YjLiu 时间: 2020-2-19 17:56

liyuanhe211 发表于 2020-2-19 13:56
这不宜描述成“有两个过渡态”，让人误以为是个两步基元反应组成的过程。这只是同一类过渡态有两个构象，这 ...

谢谢老师的解答，那如果我只找到了一个过渡态，怎么寻找他有没有其他构型？是做构型搜索吗老师？还是说有更为方便的方法，谢谢！

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2020-2-19 19:08

YjLiu 发表于 2020-2-19 17:56
谢谢老师的解答，那如果我只找到了一个过渡态，怎么寻找他有没有其他构型？是做构型搜索吗老师？还是说有 ...

对你这种简单的情况，直接手摆一下就行了。更复杂的情况就构象搜索了（不是“构型搜索”）

作者
Author: YjLiu 时间: 2020-2-20 11:01

liyuanhe211 发表于 2020-2-19 19:08
对你这种简单的情况，直接手摆一下就行了。更复杂的情况就构象搜索了（不是“构型搜索”）

好的，谢谢！那像这个文章里，为什么作者会这么摆，是考虑H和电负性强的卤素原子的作用吗？大神能否把思路分享一下呢，谢谢老师了！

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2020-2-20 11:32

YjLiu 发表于 2020-2-20 11:01
好的，谢谢！那像这个文章里，为什么作者会这么摆，是考虑H和电负性强的卤素原子的作用吗？大神能否把思 ...

它为什么这么摆我就不知道了。这么小的体系不用想太多，X-C-O-H的二面角最多最多六种鞍点（0,60,120...)，都试一遍就完了。

作者
Author: YjLiu 时间: 2020-2-22 10:27

liyuanhe211 发表于 2020-2-20 11:32
它为什么这么摆我就不知道了。这么小的体系不用想太多，X-C-O-H的二面角最多最多六种鞍点（0,60,120...) ...

好的，谢谢老师，老师您说的这个X-C-O-H二面角中，对于含有多个卤素的原子，X是不是指的被取代的那一个卤素？

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2020-2-22 16:16

YjLiu 发表于 2020-2-22 10:27
好的，谢谢老师，老师您说的这个X-C-O-H二面角中，对于含有多个卤素的原子，X是不是指的被取代的那一个卤 ...

不是，是随便哪个原子，理解成Br-C-O-H，C-C-O-H都可以

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