老师好,这篇JCPC文献 PARENT: A Parallel Software Suite for the Calculation of Configurational Entropy in Biomolecular Systems DOI号:10.1021/acs.jctc.5b01217在这篇文献中讲到了PARENT软件的使用,可以进行分子动力学(MD)的轨线作为输入文件,然后分析得到轨线坐标上的协同变化,得到类似于3D图坐标投影。
原文内容:PARENT also allows for a detailed mapping of intramolecular allosteric networks.