计算化学公社

标题: 求助NNA与ELF的Basin Population相差较大的原因 [打印本页]

作者
Author:
豌豆芽    时间: 2020-2-21 19:37
标题: 求助NNA与ELF的Basin Population相差较大的原因
老师好,我用Multiwfn对同一个的结构进行计算,分别计算了NNA和ELF的电子布居数,NNA的电子布居数为0.02,ELF的电子布居数为0.97左右。
我想请教的是:1.这两个值有没有可比性?
                       2.如果可以的话我想请教一下差值大的原因,怎么去解释两者的值差别大?



作者
Author:
sobereva    时间: 2020-2-21 19:47
没有具体体系信息(诸如输入文件、结构和吸引子分布图等等)没法回答
另外,NNA是电子密度盆分析(AIM盆分析)里的概念,和ELF盆分析也没有直接对应关系。

作者
Author:
豌豆芽    时间: 2020-2-22 21:39
sobereva 发表于 2020-2-21 19:47
没有具体体系信息(诸如输入文件、结构和吸引子分布图等等)没法回答
另外,NNA是电子密度盆分析(AIM盆分 ...

老师您好,我做的结构如图所示(Li@calix[4]pyrrole),NNA是我p上去的,C(NNA)也在这个位置上。(未能返校,数据不全,请您见谅)
(, 下载次数 Times of downloads: 19)

作者
Author:
sobereva    时间: 2020-2-22 22:57
“ELF的电子布居数”指代不明,指的是哪个ELF盆的布居数?

此体系那个NNA所在区域离原子比较远,电子密度比较低,所以NNA的盆里电子布居数很小并不意外。我手头也有个这个体系的波函数文件,我算出来的结果是0.2,没有0.02那么小。
作者
Author:
豌豆芽    时间: 2020-2-23 14:36
sobereva 发表于 2020-2-22 22:57
“ELF的电子布居数”指代不明,指的是哪个ELF盆的布居数?

此体系那个NNA所在区域离原子比较远,电子密 ...

老师好,谢谢您的指导!我算的ELF盆的位置与NNA的位置大概一样(如图),与您算的结果不一样可能是我在算的过程中向上调了Li的位置(ELF与NNA计算时Li位置一样)。正是因为计算的是同一个结构并且所选NNA与ELF盆的位置相似,所以不太清楚两者的电子布居数差别大的原因。
(, 下载次数 Times of downloads: 15)



作者
Author:
sobereva    时间: 2020-2-23 19:36
两种盆并没有足够相似性。
以下两张图分别是AIM盆(布居数0.203)和ELF盆(布居数0.774),都只显示了电子密度>0.001的部分。可见差异并不小,涵盖的空间范围明显不同。在计算积分时Multiwfn会给出盆的体积,前者是800多Bohr^3,而后者达到7000多Bohr^3,明显ELF盆涵盖的空间范围大得多,因此布居数也明显更大。

(, 下载次数 Times of downloads: 28)

(, 下载次数 Times of downloads: 16)

作者
Author:
豌豆芽    时间: 2020-2-25 10:09
sobereva 发表于 2020-2-23 19:36
两种盆并没有足够相似性。
以下两张图分别是AIM盆(布居数0.203)和ELF盆(布居数0.774),都只显示了电子 ...

好的,谢谢老师,明白了




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3