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标题: 求助：在水盒子里加离子中和电荷？ [打印本页]

作者
Author: xpyp 时间: 2015-8-25 16:53
标题: 求助：在水盒子里加离子中和电荷？
已把蛋白放在水盒子中，带8个正电荷，拟加如 8 个氯离子中和，该如何做？

作者
Author: ruanyang 时间: 2015-8-25 17:51
genion 命令！具体的可以参考 Justin 的第二个膜蛋白的教程http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... _protein/index.html

作者
Author: fhh2626 时间: 2015-8-25 21:24

ruanyang 发表于 2015-8-25 17:51
genion 命令！具体的可以参考 Justin 的第二个膜蛋白的教程http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Pers ...

LZ用的是NAMD

最简单的办法是用VMD打开，然后用里面的add ions小插件加离子至中和就行了

作者
Author: ruanyang 时间: 2015-8-25 21:41
Sorry ,没注意，NAMD直接用 VMD 中的插件就可以了

作者
Author: xpyp 时间: 2015-8-25 21:56
谢谢！

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